More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2022 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 351 aa  723    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  55.36 
 
 		 344 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002652  Flp pilus assembly protein TadD  29.31 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 3145 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 1056 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.76 
 
 		 632 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  27.67 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 878 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 629 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 927 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.12 
 
 		 810 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.53 
 
 		 988 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 		 1022 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2366  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 479 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.062914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.66 
 
 		 818 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.01 
 
 		 643 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.84 
 
 		 1154 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.91 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 3301 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3963  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.187703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 3172 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.24 
 
 		 681 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1121 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.47 
 
 		 816 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 718 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.73 
 
 		 1056 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.3 
 
 		 733 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.25 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.99 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.24 
 
 		 758 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  22.95 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 		 576 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.53 
 
 		 820 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.08 
 
 		 2145 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.27 
 
 		 603 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  19.78 
 
 		 833 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 955 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1550 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 		 1252 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 		 1252 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.89 
 
 		 916 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.55 
 
 		 626 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 685 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 1276 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 2240 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.26 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  23.23 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 583 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  22.18 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 750 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 909 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.24 
 
 		 865 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  26.26 
 
 		 581 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  23.47 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 827 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 1737 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 792 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 808 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.92 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.43 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  24.59 
 
 		 708 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.1 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  25.44 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 762 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 784 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.45 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.28 
 
 		 863 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 4079 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.68 
 
 		 689 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.21 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  24.26 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>