More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2822 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
257 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  93.77 
 
 
257 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3963  TPR repeat-containing protein  52.74 
 
 
264 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.187703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.9 
 
 
254 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 
878 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 
3145 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.71 
 
 
810 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.77 
 
 
632 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.18 
 
 
1022 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
847 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.03 
 
 
1056 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
927 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
649 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 
1056 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
1276 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
1450 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
392 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.78 
 
 
733 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.32 
 
 
875 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.11 
 
 
784 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.17 
 
 
988 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.61 
 
 
818 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
685 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  37.78 
 
 
626 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
614 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
614 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  36.67 
 
 
626 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  28.07 
 
 
344 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  37.22 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  37.22 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  37.22 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
718 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.57 
 
 
820 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
681 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.87 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
366 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
465 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
688 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 
465 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.91 
 
 
641 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
597 aa  66.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.47 
 
 
865 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
808 aa  65.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.67 
 
 
745 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1250  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  36.72 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.901782  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  30.27 
 
 
395 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.81 
 
 
816 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.89 
 
 
708 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
750 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.48 
 
 
587 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.07 
 
 
725 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.65 
 
 
764 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.55 
 
 
340 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  42.73 
 
 
754 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 
465 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
471 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 
620 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  29.05 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
686 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
543 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 
629 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.37 
 
 
795 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 
615 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.96 
 
 
620 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
637 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
602 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
291 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
594 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
301 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
612 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
212 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 
750 aa  62  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
1406 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 
565 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.6 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
301 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
356 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
909 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  29.7 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  41.82 
 
 
754 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
384 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
1421 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
629 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
441 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>