97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3977 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 716 aa  1434    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.16 
 
 		 767 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  34.41 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  29.92 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  35.63 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 226 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.27 
 
 		 820 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.36 
 
 		 561 aa  56.2  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  30.36 
 
 		 561 aa  56.2  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 3145 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 601 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 649 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 629 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  35.29 
 
 		 262 aa  53.9  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 326 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 		 214 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 220 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.45 
 
 		 2240 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 546 aa  51.2  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 		 269 aa  50.8  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 4489 aa  50.8  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 566 aa  50.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  24.53 
 
 		 815 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.07 
 
 		 810 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1056 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0802  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 362 aa  50.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 187 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.7 
 
 		 257 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1005 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 203 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 602 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  33.71 
 
 		 278 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 237 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  33.71 
 
 		 278 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 		 988 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 		 818 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 		 670 aa  48.5  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 		 1034 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 878 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  33.04 
 
 		 795 aa  48.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 597 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 592 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 		 784 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  34.83 
 
 		 281 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  33.71 
 
 		 309 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.75 
 
 		 282 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 		 201 aa  47  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2921  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 190 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 207 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 282 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 227 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 1085 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3358  tetratricopeptide TPR_4  32.56 
 
 		 271 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.37 
 
 		 222 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 		 1022 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  32.14 
 
 		 202 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.73 
 
 		 264 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 311 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 297 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  32.5 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  27.42 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  29.57 
 
 		 577 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  29.57 
 
 		 577 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 796 aa  45.8  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.39 
 
 		 725 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  30.65 
 
 		 311 aa  45.8  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.47 
 
 		 733 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 581 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 416 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 3560 aa  45.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 229 aa  45.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 639 aa  45.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.5 
 
 		 282 aa  45.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 269 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.8 
 
 		 1486 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 1038 aa  45.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 201 aa  45.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  27.42 
 
 		 585 aa  45.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 		 199 aa  45.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 1252 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  32.65 
 
 		 708 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 1252 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 542 aa  44.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.27 
 
 		 1040 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 626 aa  44.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3963  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 264 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.187703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3527  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 235 aa  44.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.29 
 
 		 416 aa  44.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 291 aa  44.3  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 808 aa  43.9  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 275 aa  43.9  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.99 
 
 		 284 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>