More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2351 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  808    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2558  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
441 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
878 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0802  tetratricopeptide TPR_2  28.75 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3977  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
716 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
3145 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
639 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
522 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  33.58 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  37.39 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
762 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 
847 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.15 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 
614 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  34.45 
 
 
875 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  35.07 
 
 
620 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 
614 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
621 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 
637 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  34.68 
 
 
299 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 
257 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.59 
 
 
632 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 
636 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
649 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  39.18 
 
 
626 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  39.18 
 
 
614 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
244 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  39.18 
 
 
614 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.09 
 
 
820 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  39.18 
 
 
614 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
715 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
602 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
1450 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
927 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.58 
 
 
267 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 
611 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  37.29 
 
 
626 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
594 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
635 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
409 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 
612 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
635 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
617 aa  63.2  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 
620 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.79 
 
 
689 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.91 
 
 
988 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
1049 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
162 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 
979 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
628 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
615 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
245 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.35 
 
 
706 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 
808 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
4079 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  34.91 
 
 
436 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
654 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
1276 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
605 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.6 
 
 
415 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  31.62 
 
 
677 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 
257 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  37.96 
 
 
1694 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
352 aa  60.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.37 
 
 
541 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
213 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
1121 aa  60.1  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
1737 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 
3560 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 
181 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  36.92 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
1406 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
824 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
194 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 
237 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.41 
 
 
573 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 
1056 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
718 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1883  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
175 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119318  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.65 
 
 
725 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
1252 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 
1022 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 
565 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
607 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
1252 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.7 
 
 
561 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  30.7 
 
 
561 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
686 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
315 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.64 
 
 
733 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
366 aa  57.4  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  34.29 
 
 
1764 aa  57  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
1486 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.75 
 
 
715 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  31.25 
 
 
1101 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
258 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
1421 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>