65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2558 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2558  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 441 aa  877    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  31.8 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 878 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0802  tetratricopeptide TPR_2  43.33 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  33.04 
 
 		 875 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 		 878 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.37 
 
 		 810 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 3145 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  38.78 
 
 		 648 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.63 
 
 		 820 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 		 461 aa  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.548615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2910  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 587 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 688 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 942 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1238 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 804 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1123  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 176 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0172242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.41 
 
 		 585 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 217 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1450 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 605 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 		 632 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1676 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  27.21 
 
 		 215 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  33.96 
 
 		 594 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 762 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 209 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0887  Tetratricopeptide domain protein  26.92 
 
 		 1339 aa  46.6  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.102317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  41.54 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 847 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 789 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.77 
 
 		 708 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 1034 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.29 
 
 		 878 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 3172 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 171 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  32.99 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  44.68 
 
 		 708 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  34.85 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 583 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  28.46 
 
 		 638 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  33.83 
 
 		 559 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1121 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3260  tetratricopeptide TPR_2  42.59 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 265 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1005 aa  43.5  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 571 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 207 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  26.89 
 
 		 593 aa  43.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 718 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 589 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.34 
 
 		 833 aa  43.1  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 315 aa  43.1  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  40.28 
 
 		 1215 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>