More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1683 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 942 aa  1966    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.05 
 
 		 906 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  27.67 
 
 		 663 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6647  Tetratricopeptide TPR_4  29.26 
 
 		 739 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2276  hypothetical protein  26.01 
 
 		 735 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1584  hypothetical protein  23.23 
 
 		 595 aa  109  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2801  cytochrome c family protein  24.71 
 
 		 488 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  24.22 
 
 		 490 aa  91.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  24.46 
 
 		 442 aa  90.1  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0679  cytochrome c family protein  23.08 
 
 		 490 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  21.49 
 
 		 457 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  21.98 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 827 aa  75.1  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 878 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  23.64 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 		 810 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 221 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.32 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 330 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 766 aa  67.8  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.6 
 
 		 738 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.16 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1676 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.27 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 1252 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.25 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 3145 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.95 
 
 		 820 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 649 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 331 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 804 aa  64.3  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.53 
 
 		 725 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 311 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 927 aa  62.4  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 409 aa  62  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.3 
 
 		 837 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 		 1252 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 265 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 		 363 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 315 aa  59.7  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 		 363 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  21.55 
 
 		 485 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  27.04 
 
 		 174 aa  59.3  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0684  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 870 aa  59.3  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  26.83 
 
 		 992 aa  58.5  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 		 1022 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1133 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.12 
 
 		 1007 aa  58.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 708 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 808 aa  57.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2283  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.976866 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1217  putative fimbrial biogenesis and twitching motility protein  30.95 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.544829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4639  hypothetical protein  22.62 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 824 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 583 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.68 
 
 		 1138 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 750 aa  57.4  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.39 
 
 		 406 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 697 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  29.01 
 
 		 535 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 288 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 243 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 718 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.04 
 
 		 1056 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.78 
 
 		 266 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 392 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 248 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 685 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 909 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  34.62 
 
 		 469 aa  57  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.05 
 
 		 875 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  29.75 
 
 		 317 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 565 aa  57  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.42 
 
 		 462 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 762 aa  56.6  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 374 aa  57  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 697 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 222 aa  56.2  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 220 aa  56.2  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 357 aa  55.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 265 aa  55.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  23.28 
 
 		 305 aa  55.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 249 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 748 aa  55.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 1737 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1421 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 3172 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 249 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 670 aa  55.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 833 aa  55.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>