More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2866 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  76.13 
 
 		 344 aa  252  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  71.14 
 
 		 366 aa  229  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  64.84 
 
 		 188 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  65.03 
 
 		 393 aa  218  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  60.84 
 
 		 387 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  64.47 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  59.76 
 
 		 178 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  62.34 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  62.42 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  60.54 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  56.17 
 
 		 373 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  55.78 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  53.33 
 
 		 460 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  47.27 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  46.92 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  42.36 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  42.07 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.62 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  42.07 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  41.38 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  42.31 
 
 		 283 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  42.64 
 
 		 283 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  42.64 
 
 		 283 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  42.64 
 
 		 240 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  42.64 
 
 		 240 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  42.64 
 
 		 240 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  42.64 
 
 		 240 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  49.14 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  42.64 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  44.63 
 
 		 271 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.86 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  44.64 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  40.31 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 		 625 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.6 
 
 		 820 aa  68.6  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  32.37 
 
 		 538 aa  65.1  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 878 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.58 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.84 
 
 		 836 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.98 
 
 		 577 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.98 
 
 		 577 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 649 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  31.01 
 
 		 837 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 649 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  37 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 646 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  29.45 
 
 		 514 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 3145 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 3560 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 		 632 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 4079 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 1022 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.25 
 
 		 1056 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 685 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.93 
 
 		 875 aa  55.5  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.51 
 
 		 1694 aa  55.1  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 864 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 718 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 635 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 637 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 713 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 635 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 611 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 988 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1180 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.24 
 
 		 1056 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 750 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 3035 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1676 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1451 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.41 
 
 		 725 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1454 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.75 
 
 		 594 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 639 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 448 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 762 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 392 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.73 
 
 		 764 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 935 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 		 626 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  40.28 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 		 626 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 1178 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 		 614 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>