82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0981 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  70.54 
 
 		 271 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  42.86 
 
 		 215 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  44 
 
 		 178 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 393 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 188 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 221 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 387 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 221 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  33.91 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  38.58 
 
 		 218 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  42.86 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 251 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 		 216 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  42.02 
 
 		 366 aa  99  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  42.61 
 
 		 196 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 216 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  33.79 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  39.5 
 
 		 216 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  38.14 
 
 		 283 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  38.14 
 
 		 283 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  38.14 
 
 		 240 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  38.14 
 
 		 240 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 240 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  38.14 
 
 		 240 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  33.55 
 
 		 345 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  41.18 
 
 		 251 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  38.66 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 		 190 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 		 190 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 219 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  41.53 
 
 		 460 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  39.83 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 625 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 174 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 750 aa  49.3  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  29.08 
 
 		 574 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  22.58 
 
 		 391 aa  48.9  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  29.79 
 
 		 575 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 792 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 890 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.84 
 
 		 642 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  29.79 
 
 		 590 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  43.9 
 
 		 246 aa  46.2  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  28.28 
 
 		 575 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 480 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  35.87 
 
 		 467 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 3172 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 		 3301 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  31.03 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  31.82 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.29 
 
 		 739 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  31.82 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 556 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 484 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 162 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 575 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 573 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 573 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 1486 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 267 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 878 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02670  peroxisome targeting signal receptor, putative  29.36 
 
 		 696 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.996882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 		 249 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2921  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 190 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.63 
 
 		 395 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  32.11 
 
 		 937 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 581 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02270  peroxisome targeting sequence binding protein, putative  25 
 
 		 799 aa  42.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.655025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>