199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1940 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  94.7 
 
 		 283 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  94.7 
 
 		 283 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  77.78 
 
 		 251 aa  380  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  79.76 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  78.57 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  78.17 
 
 		 251 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  78.57 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  94.17 
 
 		 240 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  94.17 
 
 		 240 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  94.17 
 
 		 240 aa  348  4e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  94.17 
 
 		 240 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  93.75 
 
 		 240 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  78.38 
 
 		 221 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  77.48 
 
 		 221 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  56.48 
 
 		 298 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.62 
 
 		 254 aa  285  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  62.02 
 
 		 218 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  50.77 
 
 		 196 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  43.75 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  41.75 
 
 		 216 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  46.15 
 
 		 345 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 		 219 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  45.73 
 
 		 219 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  50.86 
 
 		 190 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  50.86 
 
 		 190 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  42.31 
 
 		 215 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 		 188 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  45.26 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  46.09 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  41.86 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  39.72 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  41.73 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  45.24 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  41.06 
 
 		 178 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 460 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.53 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 625 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 878 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 1406 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.3 
 
 		 820 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 649 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 810 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 927 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 657 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 3560 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 4489 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1276 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 573 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.69 
 
 		 620 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 713 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 162 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 		 2059 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 3172 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 890 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 448 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.85 
 
 		 1694 aa  48.9  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 761 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  26.4 
 
 		 1213 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 405 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 626 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.93 
 
 		 530 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.2 
 
 		 586 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 3145 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25151  predicted protein  31.18 
 
 		 954 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160551  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 620 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 626 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.97 
 
 		 1979 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  29.14 
 
 		 530 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  28.15 
 
 		 538 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 909 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.89 
 
 		 715 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.81 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1827 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 573 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 649 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 399 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 649 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 615 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 635 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.6 
 
 		 1764 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2398  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>