More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2511 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  89.45 
 
 		 218 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  65.19 
 
 		 298 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  60.23 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  59.07 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  59.07 
 
 		 251 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  58.69 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  57.92 
 
 		 251 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  64.85 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  64.5 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  66 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  66 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  66 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  66 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  66 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  66 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  66 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  63 
 
 		 221 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 		 387 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 196 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  45.83 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  44.25 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  46.25 
 
 		 216 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  42.38 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  43.97 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  42 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  44.62 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  46.09 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  41.96 
 
 		 188 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  50.88 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  50.88 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 393 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  40.41 
 
 		 373 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  46.4 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  44.96 
 
 		 216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 460 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  47.22 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 625 aa  75.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  42.17 
 
 		 878 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  38.04 
 
 		 890 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 		 810 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 732 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30 
 
 		 820 aa  59.7  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 649 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 3560 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 317 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 649 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 649 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 1737 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 864 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.86 
 
 		 1056 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  34.07 
 
 		 452 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.55 
 
 		 632 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 646 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 714 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 		 1694 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.71 
 
 		 715 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  23.47 
 
 		 369 aa  52  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.55 
 
 		 714 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.7 
 
 		 642 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 1486 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1406 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 836 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.01 
 
 		 865 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 927 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.55 
 
 		 764 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  29.31 
 
 		 573 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 713 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.09 
 
 		 682 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 399 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2768  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.12 
 
 		 1007 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 647 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  27.13 
 
 		 1213 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 3172 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 573 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 909 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.25 
 
 		 623 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 142 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 405 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4079 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.13 
 
 		 462 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 374 aa  49.3  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 602 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 1421 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 4489 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.57 
 
 		 887 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>