174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2319 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 366 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  54.09 
 
 		 344 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  45.09 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  63.54 
 
 		 215 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  40.22 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  63.95 
 
 		 178 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  67.55 
 
 		 190 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  40.92 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  67.57 
 
 		 190 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  59.76 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  63.51 
 
 		 219 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  62.5 
 
 		 188 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  59.51 
 
 		 387 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  56.96 
 
 		 196 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  54.6 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  53.91 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  43.79 
 
 		 218 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  43.24 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  45.86 
 
 		 221 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  45.11 
 
 		 251 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  45.11 
 
 		 251 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  45.11 
 
 		 251 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.93 
 
 		 254 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  45.11 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  45.65 
 
 		 216 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  47.58 
 
 		 216 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  48.28 
 
 		 283 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  44.36 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  50.46 
 
 		 283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  50.46 
 
 		 283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  50.46 
 
 		 240 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  50.46 
 
 		 240 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  50.46 
 
 		 240 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  50.46 
 
 		 240 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  47.11 
 
 		 240 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  47.5 
 
 		 219 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 216 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  45.87 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.89 
 
 		 636 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.02 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 625 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 878 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.72 
 
 		 810 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  29.75 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4079 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.2 
 
 		 820 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 3145 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  33.58 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.77 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1753  hypothetical protein  31.43 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  32.2 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.43 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  36.56 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 3301 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 3172 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.2 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 909 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 685 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.73 
 
 		 836 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  32.74 
 
 		 243 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 		 1252 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 		 1252 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  30.87 
 
 		 837 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.12 
 
 		 462 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 1276 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 162 aa  52.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 750 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 311 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.64 
 
 		 1022 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 1180 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 718 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  27.27 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.58 
 
 		 681 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.33 
 
 		 1694 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 750 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.1 
 
 		 561 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 265 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 762 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 739 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.1 
 
 		 561 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.32 
 
 		 1764 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 988 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 		 738 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 217 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 847 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 280 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.75 
 
 		 642 aa  49.3  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 827 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  27.32 
 
 		 1101 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 934 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 649 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 917 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 		 237 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>