276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2092 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  98.95 
 
 		 190 aa  367  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  68 
 
 		 366 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  61.54 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  61.59 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  63.64 
 
 		 344 aa  191  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  62 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  56.79 
 
 		 196 aa  185  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  56.29 
 
 		 393 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  59.44 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 387 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  49.69 
 
 		 373 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  46.41 
 
 		 345 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 319 aa  141  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  46.86 
 
 		 460 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  48.28 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  49.61 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  49.61 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  56.48 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  49.61 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  49.61 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.88 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  49.61 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  49.61 
 
 		 240 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  49.61 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  50.86 
 
 		 283 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 221 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  43.45 
 
 		 251 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  43.45 
 
 		 251 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 		 251 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  39.88 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  47.33 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  47.18 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  51.35 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  50.91 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  46.67 
 
 		 251 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  41.32 
 
 		 625 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.79 
 
 		 302 aa  91.7  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 271 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 878 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  35 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  43.48 
 
 		 1764 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.45 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 632 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  36.73 
 
 		 577 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  36.73 
 
 		 577 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  33.67 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  30.07 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  33.67 
 
 		 561 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  29.06 
 
 		 452 aa  54.7  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 502 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 637 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 1406 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 718 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  30.97 
 
 		 538 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 681 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 685 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0811  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 139 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  32.28 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30 
 
 		 865 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.13 
 
 		 1694 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.46 
 
 		 764 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 4079 aa  51.2  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 828 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 		 836 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 		 589 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 268 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 596 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 762 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1676 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.44 
 
 		 642 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 3145 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 448 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 833 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 828 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 265 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 750 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.18 
 
 		 603 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.29 
 
 		 820 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 3172 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 611 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 635 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 639 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35.35 
 
 		 635 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 593 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 637 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 595 aa  48.5  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 780 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.26 
 
 		 1007 aa  48.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0731  hypothetical protein  31.25 
 
 		 567 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 1178 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  29.47 
 
 		 385 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 750 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 520 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 827 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 612 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>