94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0857 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 271 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  68.2 
 
 		 302 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  44.63 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  42.15 
 
 		 178 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 387 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  41.32 
 
 		 188 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 393 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  43.2 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  42.15 
 
 		 344 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  40.5 
 
 		 366 aa  99  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 460 aa  98.6  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  35.46 
 
 		 345 aa  96.3  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  35.43 
 
 		 218 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  40.8 
 
 		 373 aa  95.5  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.65 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  36.36 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  33.78 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 216 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  36.44 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  36.44 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  36.44 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  36.44 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  36.44 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  39.23 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  39.5 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 190 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 190 aa  89  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  40.37 
 
 		 216 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  40.37 
 
 		 216 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  36.75 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 625 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.91 
 
 		 574 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 573 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  32.99 
 
 		 573 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 573 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 573 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 424 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 435 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 750 aa  48.9  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1375  hypothetical protein  24.9 
 
 		 282 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.668942  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 405 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  29.79 
 
 		 575 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.71 
 
 		 820 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  29.79 
 
 		 590 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  28 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.36 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 399 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 890 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 575 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 480 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02670  peroxisome targeting signal receptor, putative  27.87 
 
 		 696 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.996882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.19 
 
 		 391 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02270  peroxisome targeting sequence binding protein, putative  37.97 
 
 		 799 aa  46.6  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.655025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1253  hypothetical protein  28.29 
 
 		 593 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177752  unclonable  0.0000127054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  29.47 
 
 		 575 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.83 
 
 		 642 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 331 aa  45.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 556 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  27.43 
 
 		 222 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  27.61 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1406 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.99 
 
 		 676 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 649 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 581 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 609 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  44.07 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 174 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 329 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.12 
 
 		 586 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 748 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 1486 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.09 
 
 		 397 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 217 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 878 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 595 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>