163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2585 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
424 aa  826    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2437  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 
354 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0563701  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.73 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11133  TPR repeat protein  36.24 
 
 
417 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
750 aa  63.9  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.47 
 
 
545 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.15 
 
 
725 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
515 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1755  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000139451  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  30.95 
 
 
587 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
3145 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
864 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
909 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  40.71 
 
 
594 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 
739 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
750 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  30 
 
 
625 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
566 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
583 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
685 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2201  Tfp pilus assembly protein PilF-like  29.93 
 
 
542 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  29 
 
 
594 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  30.46 
 
 
306 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
505 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
878 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
677 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  31.82 
 
 
529 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
615 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.61 
 
 
695 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
3301 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
465 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
616 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
3172 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1385  TPR domain-containing protein  25.23 
 
 
400 aa  50.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00692083 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
574 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 
624 aa  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
1454 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
1451 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
502 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  27.66 
 
 
502 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
502 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
227 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
293 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
1038 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  33 
 
 
271 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 
207 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
637 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2555  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
728 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
542 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
3035 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 
473 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  24.79 
 
 
272 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
288 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
870 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.57 
 
 
795 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5021  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.85 
 
 
295 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.667321  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
955 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.82 
 
 
603 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2102  tetratricopeptide TPR_4  26.9 
 
 
728 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.892588  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
612 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
607 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
1252 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.04 
 
 
632 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  28.86 
 
 
437 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
1252 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  25.82 
 
 
635 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.87 
 
 
1676 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  23.58 
 
 
451 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  24.65 
 
 
619 aa  46.6  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.78 
 
 
810 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 
586 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  29.55 
 
 
1230 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
681 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0632  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
198 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  23.89 
 
 
420 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  24.03 
 
 
1077 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
884 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
599 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 
394 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  28.79 
 
 
1008 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
923 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  23.68 
 
 
653 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  24.84 
 
 
607 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  37.14 
 
 
1154 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
1486 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
607 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
544 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1812  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
189 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
584 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30 
 
 
594 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.79 
 
 
764 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
607 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
1276 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
653 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>