More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1308 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  100 
 
 		 272 aa  528  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.47 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.5 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  35.32 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 1486 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.53 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 1737 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 3301 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 909 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 808 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 681 aa  82.4  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 3172 aa  82  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.11 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 562 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 632 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1069 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 3145 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 639 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 878 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 860 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.98 
 
 		 573 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.65 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.52 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.44 
 
 		 1694 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.91 
 
 		 882 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  30.81 
 
 		 792 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.77 
 
 		 807 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.89 
 
 		 733 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 2240 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 685 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.98 
 
 		 887 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  27.51 
 
 		 682 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 602 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.59 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 448 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 375 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 597 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1138 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.54 
 
 		 865 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.36 
 
 		 795 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  29.91 
 
 		 648 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 1600 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  26 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 927 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.55 
 
 		 936 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 533 aa  67  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.79 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 827 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  25.41 
 
 		 897 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 1061 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.93 
 
 		 816 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.55 
 
 		 837 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 866 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  29.76 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 879 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 601 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  24.22 
 
 		 780 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 406 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  25.33 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 637 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 581 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.63 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.29 
 
 		 764 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  21.43 
 
 		 832 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  25.22 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.39 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  26.01 
 
 		 955 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.72 
 
 		 2145 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.79 
 
 		 676 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.39 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 739 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 750 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.96 
 
 		 1764 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1676 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.67 
 
 		 882 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 649 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  24.77 
 
 		 1077 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.01 
 
 		 1154 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>