19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45989 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  41.47 
 
 		 941 aa  671    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  100 
 
 		 1008 aa  2053    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43635  predicted protein  42.58 
 
 		 847 aa  640    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  38.65 
 
 		 946 aa  621  1e-176  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39705  Pre-mRNA splicing factor prp1  29.35 
 
 		 901 aa  357  6.999999999999999e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  21.23 
 
 		 696 aa  67.8  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  24.02 
 
 		 673 aa  60.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  23.73 
 
 		 765 aa  60.1  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  31.97 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01310  spliceosome complex protein, putative  27.65 
 
 		 1031 aa  52.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 1276 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25551  predicted protein  22.06 
 
 		 692 aa  51.2  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0800445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 2262 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0393  hypothetical protein  24.43 
 
 		 177 aa  45.8  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117319  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  21.4 
 
 		 726 aa  45.8  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2585  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 424 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508719  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 968 aa  45.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04892  mRNA 3'-end-processing protein rna14 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3I8]  25.91 
 
 		 1075 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549976 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  22.01 
 
 		 690 aa  44.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>