145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47622 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  100 
 
 		 765 aa  1565    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  30.3 
 
 		 544 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  26.12 
 
 		 977 aa  93.6  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  20.17 
 
 		 696 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  20.51 
 
 		 726 aa  75.5  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  20.3 
 
 		 673 aa  73.9  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 934 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 927 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  23.73 
 
 		 1008 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  24.85 
 
 		 946 aa  59.3  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  20.2 
 
 		 1154 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  20.22 
 
 		 1421 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  36 
 
 		 941 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48786  predicted protein  20.38 
 
 		 959 aa  58.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  31.85 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88041  TPR-repeat containing protein  25 
 
 		 629 aa  57.8  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220076  normal  0.0637913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 458 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43635  predicted protein  23.33 
 
 		 847 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.62 
 
 		 2240 aa  55.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 808 aa  55.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  20.09 
 
 		 909 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 931 aa  54.3  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.21 
 
 		 725 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 4079 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.53 
 
 		 266 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 3145 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 827 aa  52.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 792 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  21.16 
 
 		 739 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 2262 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 566 aa  51.6  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 301 aa  52  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 290 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  19.65 
 
 		 409 aa  51.2  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.05 
 
 		 2059 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 2262 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 952 aa  50.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3962  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 395 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  20.83 
 
 		 581 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  20.18 
 
 		 375 aa  50.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.13 
 
 		 935 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  19.28 
 
 		 409 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00111  Pre-mRNA-splicing factor syf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH69]  26.8 
 
 		 851 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.22 
 
 		 1979 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 1424 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  19.44 
 
 		 810 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 		 466 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 515 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 575 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3385  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 427 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.981404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.44 
 
 		 988 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.73 
 
 		 632 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 377 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25 
 
 		 681 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  20.61 
 
 		 690 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0786  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 364 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300568  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  22.67 
 
 		 514 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  24.7 
 
 		 533 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 1297 aa  47.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  27.06 
 
 		 616 aa  47.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 359 aa  47.8  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 611 aa  47.8  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 634 aa  47.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  29.76 
 
 		 575 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  20.83 
 
 		 729 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  21.05 
 
 		 1252 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  22.09 
 
 		 573 aa  47.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.82 
 
 		 252 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  20.24 
 
 		 462 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  21.83 
 
 		 815 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.14 
 
 		 1276 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 1406 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  21.05 
 
 		 1252 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 		 557 aa  47  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 		 670 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  26.61 
 
 		 533 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3465  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 		 451 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0563364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  20.85 
 
 		 515 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  22.84 
 
 		 762 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  28.46 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 468 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  22.84 
 
 		 762 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  22.35 
 
 		 219 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  19.83 
 
 		 589 aa  46.2  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 227 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 		 750 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 583 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.29 
 
 		 267 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3401  Tetratricopeptide TPR_4  27.13 
 
 		 453 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0349174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 599 aa  45.8  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  20.65 
 
 		 587 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  19.23 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  24.81 
 
 		 714 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 467 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.86 
 
 		 222 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1085 aa  46.2  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 574 aa  45.4  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 201 aa  45.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 652 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>