125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43587 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  100 
 
 		 977 aa  2009    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  29.38 
 
 		 544 aa  157  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  26.12 
 
 		 765 aa  93.2  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 927 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 878 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.6 
 
 		 732 aa  71.2  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.47 
 
 		 725 aa  68.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 597 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.38 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  24.13 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  21.88 
 
 		 795 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88041  TPR-repeat containing protein  24.65 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220076  normal  0.0637913 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  29.58 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  26.51 
 
 		 726 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 909 aa  60.1  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 311 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 3145 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1590  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.93 
 
 		 294 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 4079 aa  58.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  25.52 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  26.79 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 219 aa  57.4  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  26.19 
 
 		 219 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  57  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 638 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  57  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  26.19 
 
 		 219 aa  57  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.77 
 
 		 878 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.93 
 
 		 637 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.93 
 
 		 638 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  26.19 
 
 		 219 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  26.19 
 
 		 219 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48786  predicted protein  22.45 
 
 		 959 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 375 aa  55.5  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 750 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.2 
 
 		 750 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  23.32 
 
 		 1098 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.25 
 
 		 2240 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 329 aa  53.5  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 739 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 511 aa  52.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.59 
 
 		 358 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 685 aa  52  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  22.59 
 
 		 815 aa  52  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 409 aa  52.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 384 aa  52  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 637 aa  51.2  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  21.52 
 
 		 706 aa  51.6  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  24.64 
 
 		 321 aa  50.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 217 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 864 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 1297 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  23.89 
 
 		 576 aa  50.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.26 
 
 		 865 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 409 aa  50.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 566 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 301 aa  50.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 565 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 681 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 224 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 945 aa  49.7  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.39 
 
 		 1737 aa  48.5  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16401  hypothetical protein  27.74 
 
 		 779 aa  48.5  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  23.79 
 
 		 587 aa  48.5  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 480 aa  48.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0951  tetratricopeptide TPR_2  31.71 
 
 		 613 aa  48.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 		 689 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.87 
 
 		 745 aa  48.1  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 361 aa  48.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02147  rRNA biogenesis protein RRP5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16040)  23.44 
 
 		 1780 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0471871  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  25.6 
 
 		 670 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  21.79 
 
 		 395 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  24.7 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  32.35 
 
 		 444 aa  47.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  22.26 
 
 		 918 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1114  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.69 
 
 		 261 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22274  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 366 aa  47.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 670 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 808 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  21.74 
 
 		 1484 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 359 aa  47  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 515 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  22.6 
 
 		 603 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.31 
 
 		 1252 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  20.88 
 
 		 543 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01310  spliceosome complex protein, putative  23.31 
 
 		 1031 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1138 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.35 
 
 		 594 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.16 
 
 		 884 aa  46.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 467 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  25.17 
 
 		 897 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  32.18 
 
 		 561 aa  46.2  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 1094 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  21.91 
 
 		 1252 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.87 
 
 		 293 aa  45.8  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>