More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02147 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02147  rRNA biogenesis protein RRP5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16040)  100 
 
 		 1780 aa  3636    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0471871  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  38.09 
 
 		 1484 aa  405  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  27.55 
 
 		 1869 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83216  Part of small ribosomal subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  47.37 
 
 		 1699 aa  288  7e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0841775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15354  predicted protein  37.32 
 
 		 300 aa  180  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  25.35 
 
 		 584 aa  107  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  25.15 
 
 		 584 aa  105  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  29.08 
 
 		 705 aa  104  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  26.32 
 
 		 584 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  26.26 
 
 		 586 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  24.94 
 
 		 560 aa  104  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  26.46 
 
 		 574 aa  103  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  26.72 
 
 		 573 aa  103  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  26.15 
 
 		 578 aa  102  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  25.48 
 
 		 568 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  25.48 
 
 		 568 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  25.48 
 
 		 568 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  31.88 
 
 		 579 aa  100  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  25.46 
 
 		 555 aa  94.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  23.8 
 
 		 593 aa  93.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  26.11 
 
 		 555 aa  94  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  29.6 
 
 		 387 aa  93.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  24.87 
 
 		 555 aa  93.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  25.41 
 
 		 553 aa  92.8  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  31.92 
 
 		 558 aa  92.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.09 
 
 		 501 aa  92  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  25.17 
 
 		 561 aa  92  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  26.05 
 
 		 562 aa  91.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  24.67 
 
 		 555 aa  91.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  24.9 
 
 		 577 aa  91.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  24.11 
 
 		 558 aa  90.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 		 559 aa  90.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  28.53 
 
 		 598 aa  90.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  24.83 
 
 		 560 aa  91.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  25.43 
 
 		 571 aa  90.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.97 
 
 		 411 aa  90.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  24.11 
 
 		 558 aa  90.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 		 559 aa  90.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  23.74 
 
 		 570 aa  90.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  24.59 
 
 		 559 aa  90.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  24.54 
 
 		 563 aa  89  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  24.54 
 
 		 563 aa  89  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  25.14 
 
 		 560 aa  89.4  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2939  30S ribosomal protein S1  34.34 
 
 		 403 aa  89.4  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2796  30S ribosomal protein S1  24.2 
 
 		 561 aa  89  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355849  hitchhiker  0.000269522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  24.2 
 
 		 561 aa  89  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  24.65 
 
 		 558 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  24.65 
 
 		 558 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  24.65 
 
 		 558 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  24.65 
 
 		 558 aa  88.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  26.86 
 
 		 557 aa  88.6  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  23.8 
 
 		 608 aa  87.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  24.2 
 
 		 561 aa  88.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  26.11 
 
 		 720 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  26.72 
 
 		 504 aa  88.6  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  22.67 
 
 		 577 aa  87.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  32.06 
 
 		 491 aa  87.8  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  26.74 
 
 		 566 aa  87.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  24.39 
 
 		 555 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  24.39 
 
 		 555 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  31.28 
 
 		 387 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  24.39 
 
 		 555 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  24.39 
 
 		 555 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1567  30S ribosomal protein S1  25.65 
 
 		 558 aa  87.4  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  24.72 
 
 		 609 aa  87  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  24.39 
 
 		 555 aa  87  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  24.39 
 
 		 555 aa  87  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  24.23 
 
 		 561 aa  87  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  24.52 
 
 		 555 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  24.39 
 
 		 555 aa  87  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  36.48 
 
 		 661 aa  87  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  24.39 
 
 		 555 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  24.19 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  24.46 
 
 		 555 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  23.99 
 
 		 555 aa  86.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  23.54 
 
 		 555 aa  85.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1789  30S ribosomal protein S1  23.16 
 
 		 561 aa  85.9  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123989 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  31.58 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  25.32 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  25.19 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  23.97 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  23.4 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  25.82 
 
 		 557 aa  84.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.58 
 
 		 676 aa  85.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0481  30S ribosomal protein S1  30.93 
 
 		 557 aa  84.7  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  26.69 
 
 		 561 aa  84.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  35.67 
 
 		 385 aa  84.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3013  30S ribosomal protein S1  24.11 
 
 		 556 aa  84.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000348916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0617  30S ribosomal protein S1  25.15 
 
 		 567 aa  84.3  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3124  30S ribosomal protein S1  24.08 
 
 		 562 aa  84.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00164205  normal  0.0119703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  25 
 
 		 575 aa  84.7  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  26.16 
 
 		 567 aa  83.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  24.53 
 
 		 574 aa  84  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1614  30S ribosomal protein S1  24.02 
 
 		 562 aa  84  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  26.87 
 
 		 561 aa  83.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.14 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0514  30S ribosomal protein S1  26.2 
 
 		 557 aa  83.6  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1190  30S ribosomal protein S1  30.08 
 
 		 517 aa  83.6  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  22.77 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  22.77 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>