More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1520 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 568 aa  1133    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  59.75 
 
 		 573 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 568 aa  1133    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  56.47 
 
 		 584 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  95.77 
 
 		 578 aa  1066    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 568 aa  1133    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  56.28 
 
 		 584 aa  636    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  58.77 
 
 		 596 aa  680    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  65.1 
 
 		 608 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  58.17 
 
 		 574 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  53.04 
 
 		 604 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  54.93 
 
 		 584 aa  618  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  56.57 
 
 		 586 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  51.69 
 
 		 609 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  48.32 
 
 		 577 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  49.13 
 
 		 593 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  50.09 
 
 		 574 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  49.44 
 
 		 577 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  52.62 
 
 		 573 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  50.9 
 
 		 579 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  49.53 
 
 		 570 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  48.88 
 
 		 575 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  47.28 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  49.13 
 
 		 570 aa  524  1e-147  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  48.01 
 
 		 556 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  48.91 
 
 		 558 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  49.37 
 
 		 559 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  49.09 
 
 		 558 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  49.91 
 
 		 561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  49.19 
 
 		 559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  49.19 
 
 		 559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  49.09 
 
 		 558 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00891  30S ribosomal protein S1  51.15 
 
 		 561 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  50.19 
 
 		 558 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  48.65 
 
 		 555 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  50.19 
 
 		 558 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  46.73 
 
 		 573 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  50.19 
 
 		 558 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  50.19 
 
 		 558 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  46.85 
 
 		 560 aa  509  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  50.57 
 
 		 559 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  46.96 
 
 		 571 aa  508  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  47.64 
 
 		 558 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 560 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  51.2 
 
 		 597 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  47.74 
 
 		 560 aa  501  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  47.01 
 
 		 560 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  48.25 
 
 		 720 aa  505  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  48.31 
 
 		 567 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  47.46 
 
 		 558 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  47.44 
 
 		 564 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  47.19 
 
 		 589 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  45.78 
 
 		 564 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 561 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 576 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  45.65 
 
 		 562 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  47.62 
 
 		 561 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 570 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 569 aa  498  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 569 aa  498  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  47 
 
 		 571 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  47.75 
 
 		 576 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  45.47 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 570 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  47 
 
 		 577 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  47.75 
 
 		 576 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 576 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  48.47 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  46.68 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  45.34 
 
 		 557 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  45.47 
 
 		 562 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  47.01 
 
 		 571 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  48.66 
 
 		 555 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  47.9 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  48.85 
 
 		 563 aa  490  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  48.08 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 571 aa  491  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  47.79 
 
 		 562 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  47.94 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  48.85 
 
 		 563 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  46.36 
 
 		 569 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  44.03 
 
 		 588 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  47.94 
 
 		 563 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>