More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0373 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 570 aa  1141    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  52.3 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  52.69 
 
 		 562 aa  542  1e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  49.13 
 
 		 584 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  47.64 
 
 		 596 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  48.81 
 
 		 574 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  46.93 
 
 		 573 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  49.42 
 
 		 597 aa  518  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  49.52 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  49.13 
 
 		 568 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  49.13 
 
 		 568 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  49.13 
 
 		 568 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  48.54 
 
 		 584 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  48.34 
 
 		 584 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  47.71 
 
 		 593 aa  502  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  48.02 
 
 		 577 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  48.51 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  49.21 
 
 		 575 aa  497  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  47.63 
 
 		 577 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  47.77 
 
 		 586 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  45.3 
 
 		 604 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  47.92 
 
 		 570 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  47.14 
 
 		 608 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  43.45 
 
 		 609 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  45.44 
 
 		 588 aa  463  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  47.62 
 
 		 559 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  46.3 
 
 		 644 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  46.14 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  46.84 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  44.98 
 
 		 573 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  44.8 
 
 		 560 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  43.87 
 
 		 720 aa  458  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  43.63 
 
 		 579 aa  458  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  42.73 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  45.79 
 
 		 599 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  44.66 
 
 		 592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  44.36 
 
 		 591 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  46.44 
 
 		 558 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  45.15 
 
 		 558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  46.44 
 
 		 558 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  44.83 
 
 		 560 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  46.44 
 
 		 558 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  44.27 
 
 		 592 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 560 aa  451  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 559 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 559 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  46.44 
 
 		 558 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  46.73 
 
 		 556 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0349  30S ribosomal protein S1  44.58 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000135822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  46.23 
 
 		 586 aa  445  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  44.02 
 
 		 555 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  46.53 
 
 		 556 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  42.91 
 
 		 589 aa  445  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  45.74 
 
 		 556 aa  445  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  45.24 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  45.04 
 
 		 555 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  45.54 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  43.8 
 
 		 576 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  43.6 
 
 		 576 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  43.8 
 
 		 570 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  43.8 
 
 		 570 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  43.6 
 
 		 570 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  43.6 
 
 		 576 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  43.8 
 
 		 576 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  43.97 
 
 		 559 aa  435  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  43.02 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  44.75 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  46.68 
 
 		 611 aa  435  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  43.02 
 
 		 589 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  43.02 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  45.13 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  43.3 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2762  30S ribosomal protein S1  47.19 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.841821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  45.17 
 
 		 560 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  43.65 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1951  30S ribosomal protein S1  42.8 
 
 		 606 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275526  normal  0.0589831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 570 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  45.24 
 
 		 563 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  45.14 
 
 		 619 aa  433  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2073  30S ribosomal protein S1  44.84 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000721785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  42.91 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  44.27 
 
 		 555 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  44.16 
 
 		 563 aa  432  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 555 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>