More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1981 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  56.75 
 
 		 584 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  55.18 
 
 		 573 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  100 
 
 		 604 aa  1210    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  56.75 
 
 		 584 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  60.75 
 
 		 596 aa  737    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  52.81 
 
 		 577 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  53.53 
 
 		 577 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  51.81 
 
 		 574 aa  623  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  52.01 
 
 		 593 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  52.84 
 
 		 575 aa  618  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  52.66 
 
 		 578 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  53.15 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  51.77 
 
 		 568 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  51.77 
 
 		 568 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  51.77 
 
 		 568 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  55.51 
 
 		 584 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  55.83 
 
 		 574 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  55.51 
 
 		 586 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  52.49 
 
 		 608 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  52.08 
 
 		 579 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  47.3 
 
 		 609 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  49.28 
 
 		 573 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  46.35 
 
 		 562 aa  509  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  45.05 
 
 		 561 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  46.75 
 
 		 558 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  45.23 
 
 		 561 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  45.23 
 
 		 561 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  46.9 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  46.75 
 
 		 558 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  47.96 
 
 		 720 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  46 
 
 		 573 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  44.95 
 
 		 571 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  44.62 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  45.05 
 
 		 561 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  44.1 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  45.37 
 
 		 589 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  45.81 
 
 		 576 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  45.34 
 
 		 564 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  45.81 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  46.49 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  43.44 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  43.44 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  45.8 
 
 		 588 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  45.81 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  45.63 
 
 		 576 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  45.63 
 
 		 576 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  45.81 
 
 		 576 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  46.03 
 
 		 570 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  44.91 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  45.72 
 
 		 556 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  44.62 
 
 		 555 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  46.5 
 
 		 553 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  44.4 
 
 		 558 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  44 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  44.5 
 
 		 577 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  44.6 
 
 		 565 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  45.12 
 
 		 571 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  44.78 
 
 		 565 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  44.24 
 
 		 566 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  45.39 
 
 		 560 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  44.98 
 
 		 564 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  45.12 
 
 		 577 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  44.6 
 
 		 559 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  45.56 
 
 		 557 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  45.42 
 
 		 569 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  45.34 
 
 		 575 aa  488  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  44.6 
 
 		 559 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  44.14 
 
 		 562 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  43.39 
 
 		 569 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  44.71 
 
 		 555 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  44.24 
 
 		 565 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  43.39 
 
 		 569 aa  485  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  43.35 
 
 		 560 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  44.6 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  44.88 
 
 		 560 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  45.52 
 
 		 561 aa  485  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  46.11 
 
 		 555 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  45.86 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  44.66 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 555 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  46.77 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  46.77 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  45.47 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  46.77 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  46.77 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  45.29 
 
 		 559 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  46.68 
 
 		 555 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  45.03 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  45.47 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  44.6 
 
 		 571 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  43.96 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  44.95 
 
 		 563 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>