More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2382 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  57.22 
 
 		 573 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  65.46 
 
 		 578 aa  691    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  65.1 
 
 		 568 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  100 
 
 		 608 aa  1225    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  65.1 
 
 		 568 aa  692    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  55.38 
 
 		 596 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  65.1 
 
 		 568 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  51.61 
 
 		 604 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  56.08 
 
 		 586 aa  608  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  54.73 
 
 		 574 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  54.79 
 
 		 584 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  54.79 
 
 		 584 aa  598  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  54.79 
 
 		 584 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  53.06 
 
 		 609 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  48.93 
 
 		 577 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  48.31 
 
 		 574 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  47.77 
 
 		 577 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  47.52 
 
 		 593 aa  554  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  47.64 
 
 		 575 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  48.31 
 
 		 570 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  49.37 
 
 		 579 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  52.25 
 
 		 573 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  47.79 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  47.76 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  45.59 
 
 		 556 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  48.46 
 
 		 720 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  47.83 
 
 		 562 aa  511  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  47.76 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  46.93 
 
 		 555 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  47.49 
 
 		 561 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  46.06 
 
 		 569 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  46.06 
 
 		 569 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  46.26 
 
 		 597 aa  507  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  47.42 
 
 		 559 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  47.31 
 
 		 559 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  46.06 
 
 		 560 aa  505  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  46.32 
 
 		 561 aa  502  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 589 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  47.4 
 
 		 558 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  44.46 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  47.4 
 
 		 558 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  44.46 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  46.33 
 
 		 558 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  46.33 
 
 		 558 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  44.46 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  47.4 
 
 		 558 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  44.46 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  45 
 
 		 570 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  45.18 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  44.46 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 570 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  45 
 
 		 570 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  44.46 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  45 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  47.4 
 
 		 558 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  44.46 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  45 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  44.46 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  47.14 
 
 		 570 aa  497  1e-139  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  44.54 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  47.11 
 
 		 553 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  46.95 
 
 		 560 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  44.74 
 
 		 577 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  44.74 
 
 		 571 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  44.36 
 
 		 564 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  46.88 
 
 		 557 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  44.5 
 
 		 560 aa  495  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  45.95 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  44.19 
 
 		 564 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  44.36 
 
 		 562 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  45.62 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  46.13 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  45.18 
 
 		 559 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  44.36 
 
 		 562 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  44.09 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  47.07 
 
 		 555 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  48.77 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  48.77 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2237  30S ribosomal protein S1  48.2 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000585516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2339  30S ribosomal protein S1  48.2 
 
 		 569 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00489204  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  45.81 
 
 		 563 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  45.81 
 
 		 563 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  44.64 
 
 		 562 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  48.77 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  48.58 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  48.58 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  48.58 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  45.6 
 
 		 560 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  48.77 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  48.77 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  48.58 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  48.58 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  48.77 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  45.68 
 
 		 558 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  47.07 
 
 		 555 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  48.58 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  48.77 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  48.77 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>