More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1350 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  63.03 
 
 		 574 aa  722    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  60.42 
 
 		 584 aa  698    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  55.4 
 
 		 573 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  61.76 
 
 		 584 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  63.87 
 
 		 586 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  69.44 
 
 		 573 aa  798    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  61.4 
 
 		 584 aa  710    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  100 
 
 		 579 aa  1169    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  52.33 
 
 		 596 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  53.38 
 
 		 604 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  51.02 
 
 		 577 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  49.64 
 
 		 574 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  50.09 
 
 		 577 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  50.9 
 
 		 568 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  50.9 
 
 		 568 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  50.9 
 
 		 568 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  50.28 
 
 		 570 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  51.35 
 
 		 578 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  49.44 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  46.73 
 
 		 593 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  49.37 
 
 		 608 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  45.16 
 
 		 609 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  46.85 
 
 		 569 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  46.85 
 
 		 569 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  46.87 
 
 		 562 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  46.69 
 
 		 562 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  45.88 
 
 		 557 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  46.77 
 
 		 571 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  46.87 
 
 		 562 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  46.44 
 
 		 564 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  47.33 
 
 		 555 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  46.26 
 
 		 564 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  48.19 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  48.31 
 
 		 557 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  48.57 
 
 		 555 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  47.91 
 
 		 562 aa  489  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  45.93 
 
 		 561 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  47.73 
 
 		 555 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  47.1 
 
 		 567 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  47.73 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  47.73 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  47.74 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1735  30S ribosomal protein S1  48.3 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  47.54 
 
 		 555 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2003  30S ribosomal protein S1  48.11 
 
 		 565 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0183924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  45.42 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  47.73 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  44.9 
 
 		 566 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2339  30S ribosomal protein S1  47.49 
 
 		 569 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00489204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  45.18 
 
 		 562 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  47.54 
 
 		 555 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  47.54 
 
 		 555 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  44.36 
 
 		 560 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  47.54 
 
 		 555 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  45.08 
 
 		 560 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  45.7 
 
 		 558 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  47.73 
 
 		 555 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  48 
 
 		 556 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  44.68 
 
 		 557 aa  485  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  48.11 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  45.41 
 
 		 558 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2237  30S ribosomal protein S1  48.19 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000585516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  44.57 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  48.11 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  46.73 
 
 		 559 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  44.64 
 
 		 571 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  47.54 
 
 		 555 aa  485  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  48.11 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  48.11 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  48.3 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  47.24 
 
 		 555 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  45.44 
 
 		 561 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  47.35 
 
 		 555 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1614  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 562 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  45.28 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  47.13 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  48.11 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  45.23 
 
 		 558 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  45.16 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2580  30S ribosomal protein S1  48.38 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000500826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  44.94 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  44.94 
 
 		 589 aa  482  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1789  30S ribosomal protein S1  44.21 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2073  30S ribosomal protein S1  46.74 
 
 		 555 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000721785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  44.98 
 
 		 559 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  45.16 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3124  30S ribosomal protein S1  44.78 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00164205  normal  0.0119703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2668  30S ribosomal protein S1  48.38 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  44.32 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  44.66 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 571 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  44.32 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>