More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3035 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  63.96 
 
 		 557 aa  722    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  63.96 
 
 		 557 aa  722    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  59.5 
 
 		 559 aa  678    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  63.75 
 
 		 555 aa  724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  64.75 
 
 		 558 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  75.81 
 
 		 562 aa  894    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  64.27 
 
 		 560 aa  751    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  66 
 
 		 555 aa  758    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  63.96 
 
 		 557 aa  723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  75.99 
 
 		 562 aa  895    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  63.91 
 
 		 553 aa  708    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  77.46 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2073  30S ribosomal protein S1  63.04 
 
 		 555 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000721785  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  63.57 
 
 		 555 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  64.64 
 
 		 563 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  77.46 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  62.21 
 
 		 558 aa  715    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  62.03 
 
 		 558 aa  714    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  64.64 
 
 		 563 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  59.54 
 
 		 563 aa  665    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  80.97 
 
 		 559 aa  922    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3124  30S ribosomal protein S1  70.89 
 
 		 562 aa  837    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00164205  normal  0.0119703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  76.52 
 
 		 564 aa  897    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  63.41 
 
 		 556 aa  727    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  73.33 
 
 		 573 aa  870    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  76.41 
 
 		 589 aa  892    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  77.46 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  62.72 
 
 		 561 aa  730    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  64.34 
 
 		 561 aa  755    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  63.69 
 
 		 558 aa  723    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2668  30S ribosomal protein S1  63.6 
 
 		 557 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  76.23 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  65.11 
 
 		 559 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  64.75 
 
 		 558 aa  756    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  66.01 
 
 		 559 aa  770    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  63.96 
 
 		 557 aa  722    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  77.1 
 
 		 570 aa  889    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  61.22 
 
 		 557 aa  699    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  64.47 
 
 		 555 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  77.35 
 
 		 571 aa  920    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  71.63 
 
 		 561 aa  834    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  77.46 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  76.23 
 
 		 576 aa  889    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  71.86 
 
 		 557 aa  841    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  64.66 
 
 		 555 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  58.78 
 
 		 551 aa  671    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  75.57 
 
 		 577 aa  877    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  63.96 
 
 		 557 aa  722    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  72.17 
 
 		 561 aa  842    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  71.45 
 
 		 566 aa  836    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  63.47 
 
 		 560 aa  746    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  76.41 
 
 		 576 aa  889    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  75.04 
 
 		 569 aa  894    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  75.04 
 
 		 569 aa  894    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1789  30S ribosomal protein S1  70.94 
 
 		 561 aa  835    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  75.57 
 
 		 571 aa  876    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  64.1 
 
 		 555 aa  718    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  63.69 
 
 		 558 aa  723    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  63.13 
 
 		 559 aa  725    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  71.86 
 
 		 562 aa  840    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  59.54 
 
 		 563 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  76.52 
 
 		 564 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0255  30S ribosomal protein S1  60.44 
 
 		 558 aa  683    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0579142  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  72.22 
 
 		 557 aa  846    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  63.55 
 
 		 560 aa  739    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  63.75 
 
 		 555 aa  725    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  63.96 
 
 		 557 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  58.38 
 
 		 555 aa  672    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  76.23 
 
 		 570 aa  891    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  77.46 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  71.81 
 
 		 561 aa  836    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  64.1 
 
 		 557 aa  720    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  63.75 
 
 		 555 aa  724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  64.57 
 
 		 558 aa  755    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  64.56 
 
 		 547 aa  686    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  63.57 
 
 		 555 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  63.57 
 
 		 555 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  65.65 
 
 		 561 aa  741    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  63.91 
 
 		 555 aa  718    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  63.96 
 
 		 557 aa  722    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  76.58 
 
 		 576 aa  891    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  66.01 
 
 		 559 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  77.46 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  76.23 
 
 		 576 aa  889    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  63.04 
 
 		 556 aa  725    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1955  30S ribosomal protein S1  63.42 
 
 		 557 aa  710    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132161  normal  0.358522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  63.57 
 
 		 555 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  63.83 
 
 		 560 aa  726    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  73.61 
 
 		 571 aa  847    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2580  30S ribosomal protein S1  63.6 
 
 		 557 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000500826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  64.68 
 
 		 555 aa  730    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  63.96 
 
 		 557 aa  722    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  63.75 
 
 		 555 aa  724    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  63.38 
 
 		 555 aa  720    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  77.46 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3013  30S ribosomal protein S1  63.77 
 
 		 556 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000348916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  77.46 
 
 		 570 aa  890    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  63.13 
 
 		 563 aa  731    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  64.75 
 
 		 558 aa  756    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2796  30S ribosomal protein S1  70.74 
 
 		 561 aa  831    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355849  hitchhiker  0.000269522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>