More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01200 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  100 
 
 		 1484 aa  3026    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02147  rRNA biogenesis protein RRP5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16040)  36.4 
 
 		 1780 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0471871  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  27.91 
 
 		 1869 aa  354  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83216  Part of small ribosomal subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  28.38 
 
 		 1699 aa  327  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0841775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15354  predicted protein  37.99 
 
 		 300 aa  195  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  28.53 
 
 		 559 aa  123  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  28.53 
 
 		 559 aa  123  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 		 558 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 		 558 aa  116  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 		 558 aa  116  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  28.25 
 
 		 561 aa  116  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  28.21 
 
 		 558 aa  116  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  26.88 
 
 		 559 aa  115  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  28.07 
 
 		 560 aa  115  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  28.37 
 
 		 560 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  29.05 
 
 		 556 aa  113  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  28.25 
 
 		 558 aa  113  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  28.25 
 
 		 558 aa  113  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  28.34 
 
 		 563 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  28.34 
 
 		 563 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  28.81 
 
 		 561 aa  111  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  29.01 
 
 		 555 aa  110  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  28.45 
 
 		 555 aa  110  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  27.7 
 
 		 553 aa  110  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  27.62 
 
 		 560 aa  110  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  27.5 
 
 		 561 aa  108  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  28.73 
 
 		 555 aa  109  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  27.2 
 
 		 564 aa  108  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  27.78 
 
 		 558 aa  108  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  25.06 
 
 		 557 aa  108  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  26.24 
 
 		 559 aa  108  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  23.22 
 
 		 570 aa  107  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  27.05 
 
 		 557 aa  107  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  28.18 
 
 		 555 aa  106  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  28.18 
 
 		 555 aa  106  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  28.18 
 
 		 555 aa  106  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  26.04 
 
 		 555 aa  106  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  27.37 
 
 		 557 aa  106  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  28.45 
 
 		 555 aa  106  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  28.18 
 
 		 555 aa  105  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  27.75 
 
 		 555 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  27.75 
 
 		 555 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  26.34 
 
 		 570 aa  105  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  27.75 
 
 		 555 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  27.75 
 
 		 555 aa  105  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  28.18 
 
 		 555 aa  105  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  26.34 
 
 		 568 aa  105  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  26.34 
 
 		 568 aa  105  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  26.04 
 
 		 564 aa  104  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  28.18 
 
 		 555 aa  104  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  27.9 
 
 		 555 aa  103  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  27.84 
 
 		 569 aa  104  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  27.84 
 
 		 569 aa  104  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  28.65 
 
 		 560 aa  103  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  26.45 
 
 		 570 aa  103  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  25.41 
 
 		 567 aa  103  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  26.45 
 
 		 563 aa  103  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  26.45 
 
 		 563 aa  103  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  23.93 
 
 		 604 aa  102  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  26.88 
 
 		 563 aa  102  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  22.85 
 
 		 557 aa  101  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  27.98 
 
 		 557 aa  101  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  25.62 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  26.54 
 
 		 556 aa  101  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 576 aa  101  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  26.47 
 
 		 558 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  27.04 
 
 		 547 aa  101  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  25.62 
 
 		 576 aa  101  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 576 aa  101  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  25.62 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  25.9 
 
 		 570 aa  101  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  26.04 
 
 		 562 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  26.32 
 
 		 560 aa  100  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  26.47 
 
 		 558 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  25.21 
 
 		 573 aa  100  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  25.34 
 
 		 561 aa  100  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  27.7 
 
 		 557 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  26.17 
 
 		 589 aa  100  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  27.7 
 
 		 557 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  27.7 
 
 		 557 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  27.7 
 
 		 557 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  27.3 
 
 		 559 aa  100  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  27.7 
 
 		 557 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00891  30S ribosomal protein S1  26.11 
 
 		 561 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>