More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38035 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  100 
 
 		 1869 aa  3776    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  27.66 
 
 		 1484 aa  365  4e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02147  rRNA biogenesis protein RRP5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16040)  24.3 
 
 		 1780 aa  269  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0471871  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83216  Part of small ribosomal subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  39.92 
 
 		 1699 aa  231  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0841775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15354  predicted protein  36.12 
 
 		 300 aa  187  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  25.06 
 
 		 584 aa  105  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  28.66 
 
 		 557 aa  103  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  26.71 
 
 		 559 aa  101  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  28.46 
 
 		 560 aa  98.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  26.54 
 
 		 567 aa  97.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  28 
 
 		 555 aa  96.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1349  RNA-binding S1 domain-containing protein  24.06 
 
 		 543 aa  95.9  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.143474  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  29.13 
 
 		 563 aa  94.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  25.36 
 
 		 562 aa  94.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  29.13 
 
 		 563 aa  94.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  28.74 
 
 		 561 aa  95.5  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  28.07 
 
 		 405 aa  95.1  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  24.94 
 
 		 569 aa  94  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  26.05 
 
 		 558 aa  94.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1337  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.71 
 
 		 543 aa  94.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000610744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  26.05 
 
 		 558 aa  94  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  28.2 
 
 		 403 aa  93.6  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  29.01 
 
 		 529 aa  93.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  24.77 
 
 		 569 aa  93.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  25.7 
 
 		 501 aa  93.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.89 
 
 		 514 aa  92.8  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  24.88 
 
 		 584 aa  92.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  24.88 
 
 		 584 aa  92.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  26.95 
 
 		 720 aa  91.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  26.54 
 
 		 559 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  23.8 
 
 		 570 aa  90.9  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  25.14 
 
 		 574 aa  91.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  26.92 
 
 		 558 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  25.97 
 
 		 503 aa  91.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  25.57 
 
 		 558 aa  91.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  24.26 
 
 		 570 aa  90.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  29.08 
 
 		 558 aa  90.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  26.92 
 
 		 558 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  26.92 
 
 		 558 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  26.54 
 
 		 559 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  24.49 
 
 		 570 aa  91.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  29.08 
 
 		 558 aa  90.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  26.92 
 
 		 558 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  24.55 
 
 		 571 aa  90.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  23.57 
 
 		 571 aa  90.5  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  23.59 
 
 		 565 aa  90.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  23.53 
 
 		 565 aa  90.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  28.37 
 
 		 387 aa  90.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  25.78 
 
 		 571 aa  90.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  25.27 
 
 		 569 aa  90.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  25.27 
 
 		 569 aa  90.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  25.51 
 
 		 558 aa  90.1  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  24.22 
 
 		 566 aa  89.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  29.13 
 
 		 559 aa  89.7  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  26.64 
 
 		 562 aa  89.4  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  28.35 
 
 		 556 aa  89  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  24.43 
 
 		 570 aa  88.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  24.43 
 
 		 570 aa  88.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  24.37 
 
 		 566 aa  88.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  25.93 
 
 		 491 aa  88.2  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  23.62 
 
 		 570 aa  88.6  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  26.09 
 
 		 570 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  26.09 
 
 		 570 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  26.09 
 
 		 570 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  26.09 
 
 		 570 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  25.3 
 
 		 557 aa  87.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  26.09 
 
 		 570 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1789  30S ribosomal protein S1  25.42 
 
 		 561 aa  87.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  25 
 
 		 569 aa  87.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  26.09 
 
 		 570 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  26.09 
 
 		 570 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  26.09 
 
 		 570 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  26.27 
 
 		 558 aa  87.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  23.17 
 
 		 565 aa  87  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  22.3 
 
 		 596 aa  87  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  24.25 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  24.83 
 
 		 561 aa  86.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  22.94 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  27.57 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  27.17 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  27.17 
 
 		 563 aa  85.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  24.9 
 
 		 556 aa  85.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  25.07 
 
 		 568 aa  84.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  26.77 
 
 		 561 aa  85.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  25.69 
 
 		 561 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  24.51 
 
 		 504 aa  85.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000618962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  24.44 
 
 		 571 aa  85.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  25.07 
 
 		 568 aa  84.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  24.04 
 
 		 569 aa  85.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  23.41 
 
 		 566 aa  84.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  24.9 
 
 		 557 aa  85.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  25.07 
 
 		 568 aa  84.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  24.51 
 
 		 556 aa  84.7  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  24.94 
 
 		 561 aa  84  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  30.72 
 
 		 387 aa  84.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  24.41 
 
 		 557 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  26.44 
 
 		 555 aa  83.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  24.94 
 
 		 561 aa  84  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  24.94 
 
 		 561 aa  84  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  25.14 
 
 		 579 aa  84  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>