More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2872 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 529 aa  1029    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  64.35 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  64.35 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  63.2 
 
 		 418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  68.86 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  51.34 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  60.65 
 
 		 490 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  59.47 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  59.47 
 
 		 481 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  59.47 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  58.88 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  59.47 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  59.76 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  59.17 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  59.17 
 
 		 487 aa  425  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  51.65 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  48.67 
 
 		 515 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  59.17 
 
 		 481 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  59.47 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  58.88 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  59.17 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  55.01 
 
 		 488 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  55.8 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  58.88 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  60.87 
 
 		 407 aa  422  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  59.47 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  59.17 
 
 		 492 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  59.17 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  59.23 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  57.69 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  58.31 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  58.88 
 
 		 496 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  47.05 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  58.58 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  51.72 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  56.15 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  57.27 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  57.69 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  58.28 
 
 		 488 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  57.39 
 
 		 496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  54.15 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  60.06 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  57.69 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  57.69 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  52.42 
 
 		 507 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  49.02 
 
 		 676 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  49.55 
 
 		 672 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  48.07 
 
 		 736 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  50.3 
 
 		 678 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  48.95 
 
 		 677 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  48.94 
 
 		 654 aa  323  7e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  46.73 
 
 		 557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  47.26 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  42.12 
 
 		 720 aa  309  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.36 
 
 		 415 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  46.95 
 
 		 382 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  45.64 
 
 		 584 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  46.34 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  44.61 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  42.19 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  46.65 
 
 		 382 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  46.75 
 
 		 557 aa  301  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  46.65 
 
 		 382 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  46.65 
 
 		 382 aa  301  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  46.34 
 
 		 382 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  46.65 
 
 		 382 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.47 
 
 		 411 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  46.34 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  46.65 
 
 		 382 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  44.55 
 
 		 705 aa  299  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  46.04 
 
 		 382 aa  299  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.15 
 
 		 403 aa  299  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  43.91 
 
 		 584 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  43.91 
 
 		 584 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  41.91 
 
 		 604 aa  296  5e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  45.37 
 
 		 560 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  46.5 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  45.86 
 
 		 556 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  43.7 
 
 		 568 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  45.86 
 
 		 556 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  43.7 
 
 		 568 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  43.7 
 
 		 568 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  45.78 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  44.94 
 
 		 387 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  42.11 
 
 		 573 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  43.36 
 
 		 558 aa  293  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  39.72 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  43.6 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  43.82 
 
 		 589 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  41.19 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  44.38 
 
 		 562 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>