More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3767 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  78.23 
 
 		 492 aa  742    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  76.33 
 
 		 481 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  75.86 
 
 		 485 aa  736    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  76.06 
 
 		 490 aa  734    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  80.67 
 
 		 493 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  78.51 
 
 		 485 aa  742    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  74.5 
 
 		 499 aa  723    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  78.6 
 
 		 493 aa  767    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  79.35 
 
 		 500 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  77.31 
 
 		 496 aa  752    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 507 aa  1010    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  76.94 
 
 		 481 aa  743    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  68.71 
 
 		 500 aa  635    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  80.89 
 
 		 492 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  74.95 
 
 		 491 aa  743    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  73.98 
 
 		 493 aa  710    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  77.76 
 
 		 492 aa  762    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  76.53 
 
 		 479 aa  739    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  83.4 
 
 		 493 aa  785    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  79.52 
 
 		 496 aa  746    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  76.53 
 
 		 479 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  76.2 
 
 		 485 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  76.33 
 
 		 505 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  78.27 
 
 		 488 aa  749    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  78.13 
 
 		 495 aa  763    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  78.3 
 
 		 488 aa  735    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  83.6 
 
 		 493 aa  790    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  76.18 
 
 		 488 aa  754    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  79.18 
 
 		 487 aa  751    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  75.55 
 
 		 491 aa  748    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  75.3 
 
 		 487 aa  737    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  80.16 
 
 		 480 aa  759    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  78.93 
 
 		 495 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  72.75 
 
 		 515 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  69.39 
 
 		 491 aa  677    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  75.54 
 
 		 490 aa  742    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  76.53 
 
 		 479 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  76.33 
 
 		 481 aa  735    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  65.66 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  63.9 
 
 		 405 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  63.66 
 
 		 403 aa  451  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  63.35 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  63.43 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  52.28 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  60.3 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  47.99 
 
 		 672 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  51.34 
 
 		 677 aa  333  6e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  48.22 
 
 		 676 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  49.27 
 
 		 736 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  48.96 
 
 		 678 aa  329  9e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  50.3 
 
 		 654 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  42.16 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.12 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.73 
 
 		 403 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  43.75 
 
 		 661 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  41.02 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  42.06 
 
 		 705 aa  286  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  42.55 
 
 		 560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  38.85 
 
 		 570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  41.27 
 
 		 382 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  41.46 
 
 		 559 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  42.51 
 
 		 597 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.93 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  42.53 
 
 		 563 aa  281  3e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  40.92 
 
 		 573 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  42.53 
 
 		 563 aa  280  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 558 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  43.3 
 
 		 556 aa  279  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  39.6 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  39.6 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  40.75 
 
 		 604 aa  277  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  41.38 
 
 		 720 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  44.88 
 
 		 561 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  43.48 
 
 		 687 aa  277  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  44.01 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  41.29 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  276  7e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  41.48 
 
 		 587 aa  276  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  276  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  276  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  276  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  276  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  44.58 
 
 		 560 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  39.59 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  39.59 
 
 		 562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 382 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  41.22 
 
 		 573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  40.72 
 
 		 567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  39.59 
 
 		 562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  41.18 
 
 		 589 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  40.1 
 
 		 576 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  40.1 
 
 		 576 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  40.1 
 
 		 576 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>