More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1703 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 
385 aa  760    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  48.72 
 
 
387 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  46.89 
 
 
382 aa  339  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  47.33 
 
 
736 aa  339  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  47.15 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  47.15 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  46.97 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  47.15 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  47.15 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  47.15 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  47.15 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  47.15 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  47.15 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  46.63 
 
 
382 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  52.62 
 
 
387 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  49.11 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1533  30S ribosomal protein S1  44.72 
 
 
391 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.920483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1563  30S ribosomal protein S1  44.72 
 
 
391 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.909441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  43.75 
 
 
705 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  42.23 
 
 
676 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1044  30S ribosomal protein S1  45.01 
 
 
392 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.82 
 
 
654 aa  315  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  43.82 
 
 
677 aa  315  7e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  45.23 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  40.83 
 
 
672 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.43 
 
 
661 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  42.42 
 
 
399 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  43.7 
 
 
408 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  42.78 
 
 
678 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  46.5 
 
 
529 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  45.24 
 
 
403 aa  295  8e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  44.94 
 
 
405 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  42.46 
 
 
400 aa  291  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  44.35 
 
 
418 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  43.07 
 
 
491 aa  290  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  45.02 
 
 
427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  44.61 
 
 
495 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  43.4 
 
 
493 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  43.41 
 
 
490 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  43.02 
 
 
500 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  44.91 
 
 
492 aa  279  6e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  44.01 
 
 
481 aa  279  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  44.01 
 
 
481 aa  278  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  44.01 
 
 
479 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  44.18 
 
 
495 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  44.01 
 
 
479 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  44.01 
 
 
479 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  42.86 
 
 
499 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  43.87 
 
 
485 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 
480 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  43.59 
 
 
490 aa  276  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  43.24 
 
 
500 aa  275  8e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  43.41 
 
 
481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  43.24 
 
 
487 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  41.86 
 
 
493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  43.8 
 
 
598 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  43.28 
 
 
487 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  43.88 
 
 
488 aa  272  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  43.75 
 
 
407 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  43.5 
 
 
515 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1150  30S ribosomal protein S1  42.61 
 
 
400 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000136012  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  42.98 
 
 
488 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  42.98 
 
 
492 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  43.86 
 
 
491 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  43.86 
 
 
491 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  43.03 
 
 
492 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  43.28 
 
 
488 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  42.69 
 
 
496 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  43.11 
 
 
493 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  42.99 
 
 
485 aa  265  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  42.64 
 
 
496 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  42.34 
 
 
485 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1019  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  40.85 
 
 
686 aa  260  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.901496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  39.71 
 
 
672 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  45 
 
 
411 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  43.15 
 
 
558 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 
378 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  37.79 
 
 
378 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  37.9 
 
 
687 aa  256  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  43.41 
 
 
493 aa  255  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  43.41 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  41 
 
 
587 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  41.79 
 
 
505 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  38.78 
 
 
400 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.89 
 
 
411 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.67 
 
 
403 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  39.04 
 
 
694 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2449  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  37.54 
 
 
643 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000629318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.89 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  42.51 
 
 
507 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  38.92 
 
 
560 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  38.58 
 
 
559 aa  238  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  39.19 
 
 
561 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  39.76 
 
 
596 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  39.36 
 
 
559 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  38.75 
 
 
555 aa  236  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  39.17 
 
 
563 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  38.78 
 
 
589 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  38.78 
 
 
571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  38.11 
 
 
539 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>