More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05300 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  89.6 
 
 		 405 aa  670    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  100 
 
 		 403 aa  795    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  85.07 
 
 		 407 aa  606  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  76.19 
 
 		 418 aa  579  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  65.03 
 
 		 487 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  64 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  64 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  62.85 
 
 		 495 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  62.85 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  62.01 
 
 		 492 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  64.53 
 
 		 488 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  64.39 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  63.41 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  64.16 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  63.69 
 
 		 495 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  62.57 
 
 		 480 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  64.16 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  64.16 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  60.65 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  63.95 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  63.04 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  62.57 
 
 		 490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  63.14 
 
 		 487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  63.79 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  64.24 
 
 		 490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  60.11 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  61.73 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  61.73 
 
 		 492 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  62.29 
 
 		 491 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  59.74 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  62.29 
 
 		 491 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  59.1 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  61.17 
 
 		 488 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  60.45 
 
 		 492 aa  444  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  61.24 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  64.35 
 
 		 529 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  63.01 
 
 		 485 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  65.41 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  62.72 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  65.41 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  59.49 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  63.45 
 
 		 500 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  62.01 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  63.66 
 
 		 507 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  61.97 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  53.35 
 
 		 672 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  46.02 
 
 		 736 aa  352  8.999999999999999e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  51.05 
 
 		 677 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  51.66 
 
 		 676 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  49.31 
 
 		 654 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  47.51 
 
 		 678 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  45.19 
 
 		 597 aa  309  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  48.68 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  43.79 
 
 		 573 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.99 
 
 		 411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  46.15 
 
 		 557 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  42.65 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  47.93 
 
 		 557 aa  302  7.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  47.15 
 
 		 560 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.81 
 
 		 661 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  43.23 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.57 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  47.34 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  47.34 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  45.99 
 
 		 587 aa  296  6e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  44.09 
 
 		 720 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  44.57 
 
 		 604 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  42.74 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 557 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  46.78 
 
 		 567 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  48.81 
 
 		 571 aa  292  6e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  44.82 
 
 		 562 aa  292  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  44.08 
 
 		 557 aa  292  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  46.45 
 
 		 556 aa  292  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  43.33 
 
 		 568 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  43.33 
 
 		 568 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  43.33 
 
 		 568 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  44.87 
 
 		 558 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  46.55 
 
 		 553 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  46.85 
 
 		 561 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  45.91 
 
 		 547 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  40.76 
 
 		 593 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  44.21 
 
 		 560 aa  290  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  42.32 
 
 		 596 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  44.86 
 
 		 561 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  46.29 
 
 		 555 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  45.56 
 
 		 387 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  43.94 
 
 		 555 aa  288  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  43.94 
 
 		 551 aa  288  9e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  44.57 
 
 		 561 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  45.11 
 
 		 566 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>