More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 492 aa  987    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  77.58 
 
 		 487 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  78.57 
 
 		 493 aa  718    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  79.18 
 
 		 500 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  82.02 
 
 		 487 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  79.14 
 
 		 495 aa  755    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  77.09 
 
 		 491 aa  767    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  79.84 
 
 		 496 aa  737    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  79.8 
 
 		 488 aa  776    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  80.36 
 
 		 493 aa  772    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  74.55 
 
 		 481 aa  705    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  76.06 
 
 		 485 aa  729    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  79.43 
 
 		 485 aa  736    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  82.09 
 
 		 492 aa  792    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  78.03 
 
 		 488 aa  726    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  75.76 
 
 		 481 aa  720    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  78.23 
 
 		 485 aa  761    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  76.83 
 
 		 479 aa  728    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  78.42 
 
 		 492 aa  717    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  82.08 
 
 		 490 aa  785    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  78.78 
 
 		 493 aa  720    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  81.87 
 
 		 488 aa  761    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  76.83 
 
 		 479 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  70.62 
 
 		 491 aa  701    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  80.54 
 
 		 480 aa  754    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  78.78 
 
 		 493 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  77.6 
 
 		 495 aa  743    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  70.6 
 
 		 500 aa  649    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  80.48 
 
 		 496 aa  784    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  79.8 
 
 		 493 aa  754    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  77.09 
 
 		 491 aa  767    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  76.14 
 
 		 515 aa  723    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  76.05 
 
 		 499 aa  718    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  79.04 
 
 		 490 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  78.03 
 
 		 507 aa  707    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  76.83 
 
 		 479 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  78.44 
 
 		 505 aa  701    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  75.15 
 
 		 481 aa  718    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  64.94 
 
 		 427 aa  488  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  61.39 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  61.67 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  60.45 
 
 		 403 aa  442  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  61.62 
 
 		 407 aa  425  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  57.1 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  58.53 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  49.11 
 
 		 676 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  48.99 
 
 		 736 aa  335  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  49.26 
 
 		 672 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  51.04 
 
 		 677 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  48.66 
 
 		 678 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  50.89 
 
 		 654 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  44.41 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.94 
 
 		 411 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  44.05 
 
 		 661 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.95 
 
 		 403 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  44.64 
 
 		 557 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  42.98 
 
 		 705 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  45.38 
 
 		 560 aa  290  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  45.65 
 
 		 558 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.74 
 
 		 415 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  41.95 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  42.77 
 
 		 382 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  42.12 
 
 		 720 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  41.9 
 
 		 687 aa  283  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  42.73 
 
 		 559 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 568 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 568 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 568 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  40.75 
 
 		 604 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  45.51 
 
 		 556 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  43.31 
 
 		 563 aa  280  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  43.02 
 
 		 563 aa  279  8e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  38.25 
 
 		 577 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  44.12 
 
 		 568 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  44.12 
 
 		 568 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 589 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  43.59 
 
 		 560 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  41.88 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  41.23 
 
 		 564 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  43.01 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  41.16 
 
 		 672 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  42.45 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 570 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  41.23 
 
 		 564 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 570 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 570 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 570 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  41.85 
 
 		 570 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>