More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3095 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3095  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 501 aa  977    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000127417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  56.8 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.55 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1193  RNA binding S1 domain protein  53.21 
 
 		 500 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000667111  hitchhiker  0.00401101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  38.52 
 
 		 539 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  40.38 
 
 		 661 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  37.87 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  36.2 
 
 		 598 aa  156  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  36.65 
 
 		 720 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  35.07 
 
 		 557 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  34.59 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  34.62 
 
 		 574 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0644  30S ribosomal protein S1  33.82 
 
 		 611 aa  144  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.35055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  35.85 
 
 		 573 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  37.88 
 
 		 418 aa  143  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  38.06 
 
 		 405 aa  143  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  37.1 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  34.15 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000618962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  34.96 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 577 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  33.69 
 
 		 595 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  34.59 
 
 		 584 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  35.45 
 
 		 584 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  36.04 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  34.32 
 
 		 597 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  37.65 
 
 		 387 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  35.16 
 
 		 609 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  34.59 
 
 		 589 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  35.84 
 
 		 557 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  35.34 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 561 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 577 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  34.66 
 
 		 592 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  37.21 
 
 		 500 aa  136  7.000000000000001e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  35.06 
 
 		 574 aa  136  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  35.29 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  32 
 
 		 592 aa  136  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  36.33 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  33.89 
 
 		 492 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  33.83 
 
 		 593 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  35.06 
 
 		 571 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  36.33 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  32.68 
 
 		 562 aa  136  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  34.15 
 
 		 571 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  36.33 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  35.94 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  34.07 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  34.47 
 
 		 566 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  37.69 
 
 		 407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  34.21 
 
 		 588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  36.12 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  34.6 
 
 		 575 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0873  30S ribosomal protein S1  32.35 
 
 		 551 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0435842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  34.88 
 
 		 555 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  35.9 
 
 		 491 aa  134  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  33.7 
 
 		 619 aa  134  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  35.9 
 
 		 491 aa  134  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  35.94 
 
 		 499 aa  134  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  36.74 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  35.16 
 
 		 485 aa  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  33.58 
 
 		 596 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  31.74 
 
 		 569 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  35.94 
 
 		 481 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  35.98 
 
 		 493 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  33.71 
 
 		 579 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  33.84 
 
 		 586 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  32.74 
 
 		 557 aa  133  9e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  35.94 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  34.42 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  35.53 
 
 		 488 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  35.55 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  34.48 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  35.55 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  32.73 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  33.01 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  35.74 
 
 		 515 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3013  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000348916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2073  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000721785  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  31.97 
 
 		 570 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  35.41 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  34.32 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  34.85 
 
 		 487 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  30.77 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  34.32 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1567  30S ribosomal protein S1  31.75 
 
 		 558 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  32.6 
 
 		 560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 571 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  34.59 
 
 		 568 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  32.97 
 
 		 555 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  34.59 
 
 		 568 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  34.59 
 
 		 568 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  33.22 
 
 		 599 aa  130  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  32.99 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 566 aa  130  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  32.85 
 
 		 555 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  34.08 
 
 		 678 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  34.43 
 
 		 556 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>