More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6612 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  65.12 
 
 		 575 aa  736    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  74.17 
 
 		 569 aa  868    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  77.3 
 
 		 567 aa  875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  91.7 
 
 		 570 aa  1051    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  77.84 
 
 		 566 aa  878    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  68.27 
 
 		 569 aa  753    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  91.52 
 
 		 570 aa  1049    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  91.86 
 
 		 570 aa  1046    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  81.36 
 
 		 567 aa  936    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  68.35 
 
 		 561 aa  781    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  82.13 
 
 		 569 aa  942    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  77.84 
 
 		 566 aa  878    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  99.12 
 
 		 569 aa  1130    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  81.46 
 
 		 571 aa  946    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  92.2 
 
 		 570 aa  1049    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  65.97 
 
 		 573 aa  778    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  73.42 
 
 		 566 aa  850    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  81.23 
 
 		 565 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  69.7 
 
 		 566 aa  766    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  82.46 
 
 		 577 aa  963    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  67.45 
 
 		 558 aa  763    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  76.95 
 
 		 573 aa  873    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  80.69 
 
 		 565 aa  929    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  80.69 
 
 		 565 aa  927    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  81.98 
 
 		 566 aa  940    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  69.91 
 
 		 558 aa  793    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  68.35 
 
 		 561 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  76.24 
 
 		 568 aa  862    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  66.08 
 
 		 571 aa  766    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  69.55 
 
 		 558 aa  793    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1495  30S ribosomal protein S1  69.09 
 
 		 570 aa  749    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  68.35 
 
 		 561 aa  781    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  77.05 
 
 		 569 aa  881    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  77.3 
 
 		 567 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  69.01 
 
 		 566 aa  772    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  76.94 
 
 		 566 aa  868    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  81.95 
 
 		 565 aa  941    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  80.42 
 
 		 582 aa  930    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  67.5 
 
 		 569 aa  760    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  68.64 
 
 		 571 aa  784    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 569 aa  1139    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  56.51 
 
 		 570 aa  611  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 589 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  51.07 
 
 		 576 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 570 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 570 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  51.07 
 
 		 576 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 576 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 576 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  50.89 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  50 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  50.18 
 
 		 556 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2237  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000585516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  49.65 
 
 		 571 aa  567  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2339  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00489204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  50.36 
 
 		 556 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1735  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  567  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 557 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  49.11 
 
 		 562 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  50.71 
 
 		 577 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2003  30S ribosomal protein S1  50.72 
 
 		 565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0183924  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  51.67 
 
 		 571 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  49.29 
 
 		 562 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  51.62 
 
 		 561 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  50.18 
 
 		 557 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  49.11 
 
 		 562 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  49.28 
 
 		 564 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  50.54 
 
 		 559 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  51.26 
 
 		 561 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  51.25 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  50 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  51.62 
 
 		 566 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  49.65 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  49.65 
 
 		 569 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  49.28 
 
 		 564 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  50.19 
 
 		 557 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  49.64 
 
 		 556 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  51.26 
 
 		 561 aa  559  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  49.82 
 
 		 555 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>