More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0613 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  63.73 
 
 		 556 aa  710    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0481  30S ribosomal protein S1  67.1 
 
 		 557 aa  743    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  63.49 
 
 		 556 aa  713    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0514  30S ribosomal protein S1  67.81 
 
 		 557 aa  732    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 558 aa  1103    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1567  30S ribosomal protein S1  68.32 
 
 		 558 aa  753    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1190  30S ribosomal protein S1  64.93 
 
 		 517 aa  688    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1250  30S ribosomal protein S1  66.13 
 
 		 557 aa  752    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  63.49 
 
 		 556 aa  710    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0873  30S ribosomal protein S1  57.41 
 
 		 551 aa  611  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  35.2 
 
 		 560 aa  333  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  34.64 
 
 		 579 aa  326  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  34.21 
 
 		 573 aa  325  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  35.73 
 
 		 559 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  33.92 
 
 		 584 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  35.3 
 
 		 559 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  35.3 
 
 		 559 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  33.52 
 
 		 584 aa  320  6e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  33.1 
 
 		 584 aa  319  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  33.39 
 
 		 574 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  33.04 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  33.46 
 
 		 570 aa  309  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  34.71 
 
 		 559 aa  309  9e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  35.37 
 
 		 561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  32.97 
 
 		 586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 		 577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  32.74 
 
 		 574 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  34.35 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  35.41 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  34.69 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  32.16 
 
 		 575 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  35.67 
 
 		 593 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  32.73 
 
 		 556 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  34.7 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  33.7 
 
 		 604 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  34.7 
 
 		 558 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  34.7 
 
 		 558 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  34.7 
 
 		 558 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  34.23 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  34.23 
 
 		 555 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  33.21 
 
 		 609 aa  300  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  32.5 
 
 		 570 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  33.98 
 
 		 573 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  32.03 
 
 		 596 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  34.12 
 
 		 558 aa  297  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  34.12 
 
 		 558 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0976  30S ribosomal protein S1  36.52 
 
 		 547 aa  296  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00186692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  33.69 
 
 		 558 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 561 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 		 560 aa  296  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  34.05 
 
 		 555 aa  296  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  33.45 
 
 		 569 aa  296  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  34.05 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  33.39 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  34.05 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  34.05 
 
 		 555 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  33.15 
 
 		 555 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  34.05 
 
 		 563 aa  295  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  33.45 
 
 		 569 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  34.05 
 
 		 571 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 568 aa  293  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 568 aa  293  6e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  33.51 
 
 		 555 aa  293  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  34.11 
 
 		 571 aa  293  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  33.39 
 
 		 570 aa  293  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  33.27 
 
 		 570 aa  292  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  33.51 
 
 		 555 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  33.94 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  33.87 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  33.87 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  35.68 
 
 		 566 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  33.87 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 563 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  33.75 
 
 		 565 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  33.52 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  33.69 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  33.69 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  33.94 
 
 		 565 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  33.69 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  33.69 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2732  ribosomal protein S1  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2417  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00922  hypothetical protein  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.750734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1072  30S ribosomal protein S1  35.44 
 
 		 557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000956942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 570 aa  289  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  34.05 
 
 		 569 aa  289  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  34.05 
 
 		 569 aa  289  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  32.73 
 
 		 556 aa  289  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  33.15 
 
 		 561 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  33.15 
 
 		 561 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  33.81 
 
 		 582 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  33.39 
 
 		 608 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  33.51 
 
 		 555 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  32.55 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>