More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0117 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  75.69 
 
 		 558 aa  787    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 598 aa  1188    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  52.25 
 
 		 587 aa  590  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  44.47 
 
 		 573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  41.1 
 
 		 609 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  44.12 
 
 		 596 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 584 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  41.98 
 
 		 720 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  45.2 
 
 		 584 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  44.96 
 
 		 584 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  45.61 
 
 		 608 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  42.02 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  45.01 
 
 		 578 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  43.22 
 
 		 604 aa  382  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  44.55 
 
 		 568 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  44.55 
 
 		 568 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  44.55 
 
 		 568 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  44.11 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  41.34 
 
 		 575 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  38.96 
 
 		 593 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  44.03 
 
 		 586 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  34.9 
 
 		 570 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  41.06 
 
 		 589 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  34.67 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  38.71 
 
 		 574 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  34.67 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  39.14 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  34.95 
 
 		 570 aa  364  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  40.55 
 
 		 644 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  38.96 
 
 		 569 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  38.96 
 
 		 569 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  42.53 
 
 		 571 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  39.12 
 
 		 577 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  40.99 
 
 		 576 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  42.53 
 
 		 577 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  40.99 
 
 		 576 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  40.99 
 
 		 576 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  40.99 
 
 		 576 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  34.47 
 
 		 569 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  42.3 
 
 		 570 aa  361  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  40.24 
 
 		 573 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  41.33 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  42.99 
 
 		 570 aa  357  5e-97  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  41.49 
 
 		 574 aa  357  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  40.33 
 
 		 591 aa  356  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1566  30S ribosomal protein S1  40.31 
 
 		 566 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  39.26 
 
 		 567 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  38.34 
 
 		 566 aa  354  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  43.42 
 
 		 504 aa  353  4e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  39.03 
 
 		 565 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  39.72 
 
 		 592 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  39.03 
 
 		 565 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  39.03 
 
 		 565 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1614  30S ribosomal protein S1  40.13 
 
 		 562 aa  353  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  41.39 
 
 		 561 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  39.81 
 
 		 588 aa  352  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  41.2 
 
 		 562 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  41.86 
 
 		 559 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  39.45 
 
 		 595 aa  352  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  39.03 
 
 		 565 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  41.59 
 
 		 564 aa  351  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  40.98 
 
 		 562 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  39.68 
 
 		 577 aa  351  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  35.14 
 
 		 571 aa  351  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  40.35 
 
 		 561 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0500  30S ribosomal protein S1  41.38 
 
 		 557 aa  350  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.170768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  41.59 
 
 		 564 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  39.86 
 
 		 592 aa  350  6e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  38.86 
 
 		 582 aa  349  8e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  40.98 
 
 		 562 aa  349  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  38.79 
 
 		 591 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  37.83 
 
 		 569 aa  349  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  40.18 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3124  30S ribosomal protein S1  40.72 
 
 		 562 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00164205  normal  0.0119703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  38.57 
 
 		 566 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  41.4 
 
 		 561 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1308  30S ribosomal protein S1  41.15 
 
 		 557 aa  347  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.302956  hitchhiker  0.0000000365743 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  40.4 
 
 		 557 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  41.4 
 
 		 561 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1789  30S ribosomal protein S1  39.51 
 
 		 561 aa  347  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123989 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0349  30S ribosomal protein S1  39.91 
 
 		 586 aa  347  5e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000135822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  40.09 
 
 		 555 aa  347  5e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  39.07 
 
 		 597 aa  346  8.999999999999999e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  40.04 
 
 		 571 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  42.79 
 
 		 562 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  40.09 
 
 		 571 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  38.85 
 
 		 573 aa  345  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  39.49 
 
 		 589 aa  345  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  38.41 
 
 		 569 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  38.41 
 
 		 569 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>