More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1027 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 504 aa  1007    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  43.88 
 
 		 598 aa  358  8e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  42.63 
 
 		 587 aa  349  8e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  42.35 
 
 		 558 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  38.33 
 
 		 596 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  38.75 
 
 		 575 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  38.83 
 
 		 577 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  38.48 
 
 		 573 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  37.92 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  36.4 
 
 		 609 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  36.85 
 
 		 593 aa  297  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  38.31 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  38.59 
 
 		 584 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  36.9 
 
 		 557 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  38.12 
 
 		 570 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  37.56 
 
 		 539 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  38.23 
 
 		 579 aa  292  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  37.47 
 
 		 584 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  37.47 
 
 		 584 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  36.74 
 
 		 591 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  37.32 
 
 		 588 aa  291  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  38.02 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  34.86 
 
 		 597 aa  290  5.0000000000000004e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 		 558 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 		 558 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 		 558 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  37.05 
 
 		 558 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  37.28 
 
 		 570 aa  289  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  37.3 
 
 		 720 aa  289  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  36.65 
 
 		 555 aa  289  8e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  36.65 
 
 		 551 aa  289  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  36.71 
 
 		 569 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  36.45 
 
 		 560 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  37.06 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  37.06 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  38.12 
 
 		 569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  37.33 
 
 		 559 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  35.02 
 
 		 592 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  38.07 
 
 		 570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  38.12 
 
 		 569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  37.12 
 
 		 569 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  35.43 
 
 		 592 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  36.61 
 
 		 559 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  36.61 
 
 		 559 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  37.18 
 
 		 604 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  35.49 
 
 		 566 aa  283  7.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  37.39 
 
 		 555 aa  282  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  34.75 
 
 		 591 aa  282  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  37.19 
 
 		 561 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  37.02 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  36.96 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  36.26 
 
 		 563 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  36.26 
 
 		 563 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  37.26 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  36.48 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  36.96 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  37.02 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  37.25 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  35.7 
 
 		 582 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  37.02 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  37.02 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  37.61 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  37.12 
 
 		 567 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00891  30S ribosomal protein S1  37.59 
 
 		 561 aa  280  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  37.24 
 
 		 571 aa  279  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  35.36 
 
 		 565 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  36.88 
 
 		 571 aa  279  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  36.38 
 
 		 559 aa  279  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  37.55 
 
 		 573 aa  279  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  35.62 
 
 		 569 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  36.76 
 
 		 574 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1495  30S ribosomal protein S1  37.7 
 
 		 570 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  36.79 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  35.37 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  36.11 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  36.79 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  36.79 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  36.79 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0349  30S ribosomal protein S1  37.35 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000135822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  35.14 
 
 		 565 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  36.97 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  37.02 
 
 		 555 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  34.3 
 
 		 566 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  38.21 
 
 		 558 aa  277  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  37.58 
 
 		 556 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  37.58 
 
 		 556 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  36.79 
 
 		 570 aa  276  5e-73  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  37.02 
 
 		 555 aa  276  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  34.92 
 
 		 565 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  34.92 
 
 		 565 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  34.93 
 
 		 566 aa  276  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  35.86 
 
 		 644 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  35.78 
 
 		 553 aa  276  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  36.34 
 
 		 556 aa  276  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  35.94 
 
 		 560 aa  276  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2073  30S ribosomal protein S1  36.57 
 
 		 555 aa  276  8e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000721785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  35.71 
 
 		 560 aa  276  9e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1027  30S ribosomal protein S1  36.34 
 
 		 563 aa  276  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000294308  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  35.83 
 
 		 566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  35.89 
 
 		 570 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>