More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0481 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0481  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 557 aa  1100    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  68.26 
 
 		 556 aa  730    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  67.89 
 
 		 556 aa  727    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0514  30S ribosomal protein S1  69.59 
 
 		 557 aa  756    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  68.07 
 
 		 556 aa  728    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1190  30S ribosomal protein S1  69.57 
 
 		 517 aa  715    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1250  30S ribosomal protein S1  70.56 
 
 		 557 aa  794    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1567  30S ribosomal protein S1  70.36 
 
 		 558 aa  772    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  67.1 
 
 		 558 aa  743    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0873  30S ribosomal protein S1  58.78 
 
 		 551 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0435842  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  33.97 
 
 		 577 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  34.45 
 
 		 575 aa  323  4e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  33.39 
 
 		 577 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  36.23 
 
 		 579 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  34.47 
 
 		 573 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 574 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  32.06 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  33.45 
 
 		 570 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  34.11 
 
 		 584 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  33.75 
 
 		 584 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  32.8 
 
 		 560 aa  302  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  34.59 
 
 		 573 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  33.69 
 
 		 586 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  32.68 
 
 		 584 aa  297  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  33.15 
 
 		 596 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  34.18 
 
 		 619 aa  297  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  32.12 
 
 		 604 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  33.27 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  33.22 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  32.75 
 
 		 557 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  32.98 
 
 		 559 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  33.51 
 
 		 559 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  32.98 
 
 		 559 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 558 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 558 aa  286  9e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  31.42 
 
 		 609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  32.38 
 
 		 569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  34.23 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  32.56 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  33.58 
 
 		 557 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  32.92 
 
 		 559 aa  283  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  31.92 
 
 		 561 aa  282  9e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  32.95 
 
 		 720 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  32.44 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  31.9 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  31.31 
 
 		 599 aa  280  5e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  32.38 
 
 		 560 aa  280  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  32.73 
 
 		 570 aa  279  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  32.17 
 
 		 568 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  32.17 
 
 		 568 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  31.14 
 
 		 560 aa  279  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  33.27 
 
 		 563 aa  278  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  32.44 
 
 		 561 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  32.55 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 		 570 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  32.08 
 
 		 555 aa  277  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  33.39 
 
 		 563 aa  277  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  31.91 
 
 		 644 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  32.73 
 
 		 570 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  32.5 
 
 		 567 aa  276  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  32.67 
 
 		 553 aa  276  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  32.68 
 
 		 566 aa  276  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  34.2 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  31.78 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  31.78 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  34.13 
 
 		 597 aa  274  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  30.36 
 
 		 556 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  32.26 
 
 		 565 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  32.08 
 
 		 565 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  31.42 
 
 		 561 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  32.14 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  32.08 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  31.9 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  32.14 
 
 		 566 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  31.92 
 
 		 573 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  31.74 
 
 		 560 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  31.91 
 
 		 567 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  31.6 
 
 		 571 aa  270  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  31.35 
 
 		 555 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  34.4 
 
 		 592 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  31.74 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  31.96 
 
 		 555 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  31.63 
 
 		 558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  31.63 
 
 		 558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  31.63 
 
 		 558 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  32.68 
 
 		 569 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  32.68 
 
 		 569 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  31.63 
 
 		 558 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 555 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2762  30S ribosomal protein S1  33.27 
 
 		 591 aa  267  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.841821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 555 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 555 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 555 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  32.08 
 
 		 555 aa  267  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 555 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>