More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3564 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  99.21 
 
 
638 aa  1150    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
637 aa  1161    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  93.87 
 
 
638 aa  913    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  65.66 
 
 
634 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
878 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.92 
 
 
810 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.36 
 
 
725 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.1 
 
 
1676 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 
632 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
681 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
685 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
505 aa  123  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
909 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 
927 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 
689 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
362 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
3145 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.1 
 
 
1694 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  35.75 
 
 
764 aa  114  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.33 
 
 
733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.76 
 
 
622 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
637 aa  111  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.98 
 
 
397 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.75 
 
 
816 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.87 
 
 
887 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.55 
 
 
462 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 
2240 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
4079 aa  107  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.38 
 
 
603 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 
1276 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
762 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
718 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 
714 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
1737 aa  104  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
583 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.51 
 
 
865 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  23.39 
 
 
706 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
750 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.39 
 
 
1022 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
1450 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
3172 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.84 
 
 
795 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 
739 aa  97.8  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
1192 aa  97.4  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 
714 aa  97.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
465 aa  97.4  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.19 
 
 
884 aa  97.4  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 
3301 aa  97.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
573 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
597 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 
612 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.57 
 
 
594 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
589 aa  95.9  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
542 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
217 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.62 
 
 
314 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
543 aa  93.2  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
827 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 
468 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 
566 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.21 
 
 
334 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
955 aa  92.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 
934 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
2262 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 
1421 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.77 
 
 
681 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.66 
 
 
707 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
243 aa  91.3  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.61 
 
 
620 aa  90.9  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  27.37 
 
 
661 aa  90.9  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 
2262 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.77 
 
 
750 aa  90.5  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 
620 aa  90.5  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.38 
 
 
293 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.84 
 
 
936 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  33.05 
 
 
266 aa  89.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.99 
 
 
988 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
374 aa  89.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 
886 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
275 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
465 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
366 aa  89  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  22.83 
 
 
815 aa  88.6  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
1178 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 
1056 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  22.87 
 
 
564 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
392 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
3035 aa  88.6  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 
602 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 
639 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  25.96 
 
 
321 aa  87.8  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.73 
 
 
875 aa  87.8  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  28.46 
 
 
601 aa  87.4  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 
615 aa  87.4  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
313 aa  87  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
847 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  21.41 
 
 
706 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 
1406 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.55 
 
 
730 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>