26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_01259 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  48.12 
 
 		 690 aa  639    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  100 
 
 		 673 aa  1371    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  51.39 
 
 		 696 aa  680    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  55.7 
 
 		 726 aa  729    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  39.77 
 
 		 714 aa  504  1e-141  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  20.3 
 
 		 765 aa  73.9  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01310  spliceosome complex protein, putative  24.35 
 
 		 1031 aa  70.5  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  22.27 
 
 		 941 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  21.77 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  24.13 
 
 		 977 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43635  predicted protein  22.22 
 
 		 847 aa  64.7  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39705  Pre-mRNA splicing factor prp1  24.04 
 
 		 901 aa  64.7  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00111  Pre-mRNA-splicing factor syf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH69]  21.48 
 
 		 851 aa  63.9  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  20.38 
 
 		 946 aa  61.6  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  24.02 
 
 		 1008 aa  60.8  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15354  predicted protein  22.46 
 
 		 300 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267179  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25551  predicted protein  22.05 
 
 		 692 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0800445  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  25.86 
 
 		 1869 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42299  predicted protein  21.08 
 
 		 873 aa  54.7  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13053  predicted protein  25.51 
 
 		 725 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.34373  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01635  mRNA splicing protein (Prp39), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09010)  26.48 
 
 		 588 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83216  Part of small ribosomal subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  26.34 
 
 		 1699 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0841775  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04892  mRNA 3'-end-processing protein rna14 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3I8]  29.07 
 
 		 1075 aa  44.3  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549976 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42368  predicted protein  21.77 
 
 		 563 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0945405  normal  0.143131 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88041  TPR-repeat containing protein  21.14 
 
 		 629 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220076  normal  0.0637913 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  21.66 
 
 		 1484 aa  43.9  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>