32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06730 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  55.14 
 
 		 673 aa  732    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  100 
 
 		 726 aa  1461    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  47.6 
 
 		 696 aa  627  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  44.73 
 
 		 690 aa  572  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53682  predicted protein  35.8 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  20.76 
 
 		 765 aa  74.3  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  29.26 
 
 		 1869 aa  67.8  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42299  predicted protein  26.03 
 
 		 873 aa  63.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39705  Pre-mRNA splicing factor prp1  22.63 
 
 		 901 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  22.76 
 
 		 941 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 2262 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  25.73 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43587  predicted protein  28.74 
 
 		 977 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01310  spliceosome complex protein, putative  22.75 
 
 		 1031 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00111  Pre-mRNA-splicing factor syf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH69]  22.53 
 
 		 851 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 2262 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43635  predicted protein  21.65 
 
 		 847 aa  52.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13053  predicted protein  22.67 
 
 		 725 aa  51.2  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.34373  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01200  rRNA processing-related protein, putative  22.87 
 
 		 1484 aa  51.2  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88041  TPR-repeat containing protein  25.61 
 
 		 629 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.220076  normal  0.0637913 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04892  mRNA 3'-end-processing protein rna14 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3I8]  32.95 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  20.91 
 
 		 466 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83216  Part of small ribosomal subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  38.46 
 
 		 1699 aa  49.3  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0841775  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02147  rRNA biogenesis protein RRP5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16040)  22.79 
 
 		 1780 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0471871  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42368  predicted protein  22.43 
 
 		 563 aa  48.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0945405  normal  0.143131 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01635  mRNA splicing protein (Prp39), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09010)  26.14 
 
 		 588 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  30.68 
 
 		 946 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25551  predicted protein  22.88 
 
 		 692 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0800445  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  21.6 
 
 		 1008 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70712  U3 snoRNP protein  27.04 
 
 		 434 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.555676 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 		 375 aa  45.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.59 
 
 		 1067 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>