13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42299 on replicon NC_009373
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009373  OSTLU_42299  predicted protein  100 
 
 		 873 aa  1781    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00111  Pre-mRNA-splicing factor syf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH69]  40.28 
 
 		 851 aa  622  1e-177  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01310  spliceosome complex protein, putative  43.87 
 
 		 1031 aa  496  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13053  predicted protein  34.51 
 
 		 725 aa  424  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.34373  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51927  predicted protein  24.62 
 
 		 854 aa  232  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176454  normal  0.69842 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  26.03 
 
 		 726 aa  64.3  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  21.45 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  23.36 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  20.9 
 
 		 673 aa  57.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  23.21 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83216  Part of small ribosomal subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  21.38 
 
 		 1699 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0841775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38035  predicted protein  22.08 
 
 		 1869 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0179427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4009  hypothetical protein  34.38 
 
 		 241 aa  44.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000600664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>