15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43635 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43635  predicted protein  100 
 
 		 847 aa  1712    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45989  predicted protein  42.3 
 
 		 1008 aa  665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400632  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00710  pre-mRNA splicing factor prp1, putative  41.25 
 
 		 946 aa  608  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.547118  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07447  mRNA splicing factor (Prp1/Zer1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06070)  40.28 
 
 		 941 aa  587  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.143301  normal  0.632834 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39705  Pre-mRNA splicing factor prp1  28.31 
 
 		 901 aa  346  8e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36244  predicted protein  22.08 
 
 		 696 aa  68.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01259  Pre-mRNA-splicing factor clf1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDX1]  22.22 
 
 		 673 aa  65.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.588968  normal  0.14932 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20135  predicted protein  21.06 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06730  RNA splicing-related protein, putative  21.83 
 
 		 726 aa  56.6  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525366  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25551  predicted protein  21.49 
 
 		 692 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0800445  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47622  predicted protein  23.33 
 
 		 765 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  22.36 
 
 		 544 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 515 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02147  rRNA biogenesis protein RRP5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16040)  27.74 
 
 		 1780 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0471871  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24 
 
 		 725 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>