More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0911 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
515 aa  1036    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
878 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.46 
 
 
810 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
685 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
505 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.22 
 
 
1737 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
689 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22 
 
 
725 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.27 
 
 
887 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
3145 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 
2240 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
748 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
1276 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 
1421 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.66 
 
 
397 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
808 aa  87.8  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.3 
 
 
632 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 
4079 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.18 
 
 
1676 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.8 
 
 
582 aa  83.6  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 
934 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.61 
 
 
622 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
486 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.57 
 
 
832 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 
3172 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 
750 aa  76.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
612 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.96 
 
 
935 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.28 
 
 
1694 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.31 
 
 
784 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.08 
 
 
764 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  28.23 
 
 
594 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  23.34 
 
 
929 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.91 
 
 
818 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
1061 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.91 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.93 
 
 
816 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.49 
 
 
587 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
567 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 
3301 aa  70.5  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
909 aa  70.1  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  24.91 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.84 
 
 
676 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
739 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  25.23 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.26 
 
 
573 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
681 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.97 
 
 
733 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
1406 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  23.4 
 
 
648 aa  69.3  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.65 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
883 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
1180 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.66 
 
 
729 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.33 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.62 
 
 
882 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.78 
 
 
1056 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 
402 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.85 
 
 
572 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
686 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 
466 aa  66.6  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.28 
 
 
293 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
573 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.13 
 
 
293 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
827 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
313 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.01 
 
 
363 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0823  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
502 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.01 
 
 
363 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  21.49 
 
 
955 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.38 
 
 
1056 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
249 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
249 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.82 
 
 
568 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.3 
 
 
572 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
762 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  24.43 
 
 
594 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
968 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
201 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 
528 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
594 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
646 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.32 
 
 
545 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.11 
 
 
988 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
377 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.58 
 
 
795 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 
593 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 
927 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.21 
 
 
1764 aa  63.9  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 
1297 aa  63.9  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 
952 aa  63.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 
847 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>