More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2480 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  47.29 
 
 		 864 aa  774    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  46.25 
 
 		 883 aa  778    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  57.43 
 
 		 884 aa  995    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  95.35 
 
 		 882 aa  1669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  48.42 
 
 		 860 aa  830    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  100 
 
 		 882 aa  1773    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.08 
 
 		 884 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.43 
 
 		 883 aa  356  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 886 aa  343  8e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 886 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 934 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 931 aa  190  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.08 
 
 		 988 aa  158  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.8 
 
 		 929 aa  151  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.07 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.82 
 
 		 1056 aa  145  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.87 
 
 		 1056 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.15 
 
 		 1022 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 878 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 		 927 aa  135  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1676 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 		 818 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.3 
 
 		 810 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.3 
 
 		 784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 767 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.36 
 
 		 2240 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 		 748 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 729 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 927 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 923 aa  118  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 4079 aa  118  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 		 1069 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 800 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 955 aa  109  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 3145 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 944 aa  105  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.16 
 
 		 786 aa  104  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.01 
 
 		 935 aa  104  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.54 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  24.84 
 
 		 924 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.39 
 
 		 924 aa  102  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 847 aa  101  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 873 aa  101  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 722 aa  101  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 568 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.97 
 
 		 582 aa  98.6  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.6 
 
 		 573 aa  96.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 620 aa  94.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 573 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 750 aa  94  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  22.2 
 
 		 892 aa  93.2  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.02 
 
 		 1056 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.98 
 
 		 624 aa  92.8  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.21 
 
 		 1737 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 579 aa  89.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 1276 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 1421 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  19.53 
 
 		 1979 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 392 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  20.98 
 
 		 567 aa  89  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  30.33 
 
 		 632 aa  88.6  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 3172 aa  87.8  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  22.33 
 
 		 979 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  23.01 
 
 		 917 aa  86.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 		 586 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.24 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 465 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.76 
 
 		 875 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 565 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  24.65 
 
 		 638 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 952 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.55 
 
 		 573 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.74 
 
 		 758 aa  82.8  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.11 
 
 		 887 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.64 
 
 		 745 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 643 aa  82  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 827 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.47 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  20.52 
 
 		 543 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 622 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  20.38 
 
 		 605 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 602 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.04 
 
 		 725 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 649 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 634 aa  79.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.65 
 
 		 689 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1112 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.15 
 
 		 1694 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.57 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 566 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 592 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.35 
 
 		 3301 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 900 aa  77.8  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  21.93 
 
 		 764 aa  78.2  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  24.56 
 
 		 621 aa  77.4  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 592 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  24.56 
 
 		 621 aa  77.4  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>