More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2032 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  49.53 
 
 		 864 aa  807    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 883 aa  1758    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  46.18 
 
 		 860 aa  796    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  45.68 
 
 		 882 aa  746    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  49.6 
 
 		 884 aa  840    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  46.25 
 
 		 882 aa  759    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  32.57 
 
 		 884 aa  439  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 886 aa  351  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.84 
 
 		 883 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 886 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  26.09 
 
 		 929 aa  207  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 934 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 931 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1676 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.84 
 
 		 1056 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.91 
 
 		 786 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 923 aa  161  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  23.73 
 
 		 924 aa  160  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.4 
 
 		 988 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 927 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.41 
 
 		 1056 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.36 
 
 		 729 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 878 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.58 
 
 		 2240 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.53 
 
 		 4079 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.21 
 
 		 935 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.73 
 
 		 1022 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.53 
 
 		 810 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.26 
 
 		 818 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 944 aa  125  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 767 aa  124  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 927 aa  124  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  25.64 
 
 		 924 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 568 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 573 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  23.6 
 
 		 632 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 567 aa  118  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 900 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.09 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.97 
 
 		 1979 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.56 
 
 		 573 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 1069 aa  111  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.38 
 
 		 784 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 952 aa  110  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 572 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  21.32 
 
 		 1694 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.41 
 
 		 572 aa  107  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 847 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 748 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  21.25 
 
 		 892 aa  105  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 620 aa  105  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 566 aa  104  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 722 aa  104  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  22.56 
 
 		 918 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 638 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 3145 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.17 
 
 		 936 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  22.28 
 
 		 914 aa  98.2  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 		 1737 aa  97.8  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.43 
 
 		 887 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 632 aa  97.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 586 aa  97.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1138 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.77 
 
 		 566 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 880 aa  95.9  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 750 aa  95.1  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 594 aa  93.6  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.8 
 
 		 745 aa  94  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 808 aa  93.2  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  22.21 
 
 		 937 aa  92.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 800 aa  92  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.39 
 
 		 725 aa  92  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  19.08 
 
 		 1067 aa  92  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 1276 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 		 562 aa  91.3  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 917 aa  90.9  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.21 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  21.41 
 
 		 917 aa  89.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 634 aa  87.8  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 392 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24.93 
 
 		 626 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  22.89 
 
 		 603 aa  87  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 448 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.03 
 
 		 3301 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 621 aa  87.4  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.33 
 
 		 557 aa  87  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.4 
 
 		 632 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 621 aa  86.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 643 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 		 639 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 621 aa  86.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.81 
 
 		 624 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.41 
 
 		 979 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  26.69 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.46 
 
 		 758 aa  85.5  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  20.19 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>