More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24071 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  100 
 
 
622 aa  1290    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  55.35 
 
 
725 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  47.12 
 
 
587 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  96.18 
 
 
764 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  49.34 
 
 
545 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  43.05 
 
 
681 aa  234  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 
878 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.46 
 
 
810 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 
685 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  38.65 
 
 
909 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  40.75 
 
 
637 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 
362 aa  210  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.41 
 
 
632 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 
1094 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 
3035 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 
4489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 
3560 aa  198  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  39.05 
 
 
875 aa  194  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  37.29 
 
 
865 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  34.04 
 
 
816 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  36.68 
 
 
1694 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 
750 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
3145 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 
739 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.24 
 
 
714 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
505 aa  174  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
828 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  41.12 
 
 
603 aa  173  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
828 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
714 aa  171  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 
824 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  31.65 
 
 
1676 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 
718 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  34.07 
 
 
626 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  34.08 
 
 
661 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 
3172 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
614 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.7 
 
 
626 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  43.78 
 
 
583 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
626 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.69 
 
 
733 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
3301 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
732 aa  157  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  38.43 
 
 
833 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
828 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.53 
 
 
1022 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
1737 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.76 
 
 
887 aa  154  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
955 aa  154  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 
1827 aa  153  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
649 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
789 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
614 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.89 
 
 
462 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.18 
 
 
594 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  38.98 
 
 
1007 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
1486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
1276 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
754 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
597 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
543 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
935 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  29.33 
 
 
936 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
615 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.1 
 
 
1056 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  37 
 
 
833 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.44 
 
 
818 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
620 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
602 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
761 aa  144  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.88 
 
 
784 aa  143  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
573 aa  143  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 
639 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  35.75 
 
 
594 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.67 
 
 
620 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  29.36 
 
 
979 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  30.09 
 
 
321 aa  141  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.52 
 
 
676 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
1406 aa  141  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 
988 aa  140  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
1056 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
608 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
808 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
601 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
612 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.55 
 
 
397 aa  136  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
754 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  30.43 
 
 
725 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  39.33 
 
 
750 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
1085 aa  136  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.7 
 
 
837 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
637 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
713 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.24 
 
 
354 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>