More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_00731 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  44.88 
 
 		 739 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  65.52 
 
 		 750 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  65.59 
 
 		 909 aa  1184    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1664    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.97 
 
 		 4489 aa  515  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 		 1094 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 3560 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 3035 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  65.49 
 
 		 681 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  65.63 
 
 		 685 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 		 1085 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 761 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  64.62 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  63.76 
 
 		 865 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  36.66 
 
 		 654 aa  432  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  65.94 
 
 		 637 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 700 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  36.77 
 
 		 732 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  50.13 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 808 aa  366  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 667 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  38.72 
 
 		 616 aa  362  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 706 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 		 611 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 618 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 632 aa  350  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  56.27 
 
 		 612 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  59.29 
 
 		 603 aa  344  5e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 740 aa  336  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 828 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 828 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 647 aa  324  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 828 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 833 aa  318  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 833 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 789 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 660 aa  311  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 732 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 754 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 824 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 750 aa  301  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  34.53 
 
 		 560 aa  300  8e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 754 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.4 
 
 		 1106 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 569 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  55.1 
 
 		 583 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 574 aa  283  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1106 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  47.15 
 
 		 878 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 718 aa  279  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 708 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  31.76 
 
 		 680 aa  276  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.89 
 
 		 585 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.93 
 
 		 708 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.55 
 
 		 810 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 968 aa  258  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  38.35 
 
 		 492 aa  256  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.24 
 
 		 739 aa  256  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  31.72 
 
 		 632 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.07 
 
 		 739 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.74 
 
 		 1154 aa  248  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  44.09 
 
 		 295 aa  246  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 1714 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  26.82 
 
 		 568 aa  244  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.51 
 
 		 714 aa  241  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  36.21 
 
 		 566 aa  240  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 		 570 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 714 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  33.91 
 
 		 657 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  34.93 
 
 		 459 aa  238  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 590 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  28.96 
 
 		 590 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  35.31 
 
 		 657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  35.75 
 
 		 452 aa  235  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 633 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.55 
 
 		 742 aa  233  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.75 
 
 		 739 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 626 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 589 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  31.86 
 
 		 637 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.03 
 
 		 837 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.22 
 
 		 632 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 789 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  36.15 
 
 		 725 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.38 
 
 		 715 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  38.8 
 
 		 795 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 672 aa  228  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 713 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 647 aa  226  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 627 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  63.29 
 
 		 430 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 598 aa  224  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 595 aa  223  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.66 
 
 		 589 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 750 aa  223  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 619 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  35.21 
 
 		 633 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.91 
 
 		 667 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.14 
 
 		 630 aa  220  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 717 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>