293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3091 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1416    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 611 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  37.12 
 
 		 654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 		 3560 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 		 1085 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 		 700 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 3035 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 909 aa  301  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 750 aa  297  5e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 4489 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 761 aa  293  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 1094 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 647 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 739 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.76 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  40.41 
 
 		 459 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  35.19 
 
 		 590 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 740 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 		 574 aa  272  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  35.01 
 
 		 590 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  41.46 
 
 		 492 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 618 aa  267  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 808 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 		 667 aa  262  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 569 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 706 aa  259  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  34.84 
 
 		 560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 732 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  39.8 
 
 		 452 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  36.96 
 
 		 395 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 660 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.75 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  36.03 
 
 		 568 aa  243  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  34.96 
 
 		 566 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  35.59 
 
 		 632 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 708 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.96 
 
 		 588 aa  223  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 672 aa  223  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 750 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 		 589 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  32.66 
 
 		 633 aa  217  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.03 
 
 		 585 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 754 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  33.59 
 
 		 637 aa  207  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 828 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 295 aa  205  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.06 
 
 		 630 aa  204  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 626 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 732 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  32.39 
 
 		 657 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 		 589 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 754 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  31.34 
 
 		 657 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 968 aa  196  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 828 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 789 aa  194  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 633 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 828 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  30.26 
 
 		 624 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 699 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 619 aa  187  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  33.25 
 
 		 582 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 529 aa  183  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1714 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  30.46 
 
 		 1221 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 789 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 833 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 595 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  32.3 
 
 		 937 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 		 1106 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  30.89 
 
 		 1415 aa  171  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 833 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1106 aa  170  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 727 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  28.39 
 
 		 719 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 717 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.21 
 
 		 667 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.92 
 
 		 708 aa  167  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 739 aa  167  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  27.41 
 
 		 596 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 647 aa  163  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.51 
 
 		 739 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 713 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 718 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  26.62 
 
 		 821 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 776 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 776 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  30.33 
 
 		 594 aa  160  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  26.44 
 
 		 776 aa  160  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 796 aa  160  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  26.44 
 
 		 776 aa  160  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  26.44 
 
 		 776 aa  160  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  26.44 
 
 		 821 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 824 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 734 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>