169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3428 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 560 aa  1145    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  38.74 
 
 		 616 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 3560 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 1094 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  37.83 
 
 		 1085 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  38.49 
 
 		 4489 aa  334  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  39.8 
 
 		 654 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  38.48 
 
 		 740 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 750 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 761 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 		 3035 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 909 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  34.53 
 
 		 816 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  39.35 
 
 		 566 aa  294  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  38.72 
 
 		 569 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 		 667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 647 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 732 aa  283  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 611 aa  280  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 660 aa  277  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 		 700 aa  274  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  37.66 
 
 		 395 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 739 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  38.87 
 
 		 633 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 		 574 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  41.14 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  34.84 
 
 		 680 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 672 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  33.73 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  35.94 
 
 		 657 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.48 
 
 		 570 aa  253  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  36.9 
 
 		 632 aa  253  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  36.06 
 
 		 630 aa  251  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  39.16 
 
 		 459 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  35.34 
 
 		 568 aa  250  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  35.75 
 
 		 657 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  37.83 
 
 		 582 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 590 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 808 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  35.26 
 
 		 590 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  36.39 
 
 		 637 aa  239  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 632 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  38.36 
 
 		 452 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  36.36 
 
 		 624 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 750 aa  219  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 		 1106 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 1106 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.59 
 
 		 589 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 706 aa  198  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 		 589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 821 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 776 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 776 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 		 776 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 776 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 		 821 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 776 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1714 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  30.1 
 
 		 790 aa  187  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 295 aa  187  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.26 
 
 		 585 aa  183  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 754 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.39 
 
 		 790 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.25 
 
 		 529 aa  180  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.54 
 
 		 596 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  32.91 
 
 		 937 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.6 
 
 		 667 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 968 aa  176  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 734 aa  176  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 708 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 647 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 789 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 754 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 		 627 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 633 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.63 
 
 		 699 aa  170  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  26.6 
 
 		 719 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 717 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  29.07 
 
 		 1596 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 727 aa  167  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 1116 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 789 aa  164  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 796 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 732 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  26.93 
 
 		 745 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 739 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 713 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  29.46 
 
 		 1221 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 		 780 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 619 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 780 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  27.71 
 
 		 747 aa  158  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 779 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  30.5 
 
 		 552 aa  157  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 626 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 1143 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 		 595 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 828 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>